More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6043 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_6043  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 265 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2141  alpha/beta hydrolase fold  68.32 
 
 		 268 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0335838 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3943  alpha/beta fold family hydrolase  68.18 
 
 		 268 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0615663  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2310  alpha/beta hydrolase fold  68.85 
 
 		 264 aa  352  2.9999999999999997e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1894  alpha/beta hydrolase fold  67.56 
 
 		 268 aa  349  3e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3929  alpha/beta hydrolase fold  64.68 
 
 		 278 aa  340  1e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.419283  decreased coverage  0.00575896 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2513  Alpha/beta hydrolase fold  63.06 
 
 		 276 aa  340  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3787  Alpha/beta hydrolase fold  62.83 
 
 		 274 aa  339  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3578  alpha/beta hydrolase fold  67.8 
 
 		 268 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.396236 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1851  alpha/beta hydrolase fold  65.53 
 
 		 283 aa  320  9.999999999999999e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4284  alpha/beta hydrolase fold protein  56.65 
 
 		 268 aa  303  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3485  alpha/beta hydrolase fold  59.26 
 
 		 276 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0215  alpha/beta family hydrolase  58.58 
 
 		 274 aa  295  5e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00842638  normal  0.87662 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4326  alpha/beta hydrolase fold  60.37 
 
 		 276 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.703871  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4040  alpha/beta hydrolase fold  60.37 
 
 		 276 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4549  alpha/beta hydrolase fold  60.37 
 
 		 276 aa  289  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.565674  normal  0.972542 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 		 275 aa  90.1  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  28.94 
 
 		 275 aa  87.8  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3478  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 295 aa  85.5  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2698  alpha/beta hydrolase fold  32.43 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.705965  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2742  alpha/beta hydrolase fold  32.43 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2728  alpha/beta hydrolase fold  32.05 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal  0.292016 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1647  alpha/beta hydrolase fold protein  29.06 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4072  alpha/beta hydrolase fold  29.78 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.523651  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  24.42 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  28.78 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  39.83 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  39.32 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3527  alpha/beta hydrolase fold protein  27.02 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  38.84 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  27.17 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  37.61 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  34.51 
 
 		 311 aa  68.9  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1517  alpha/beta hydrolase fold protein  22.44 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00660  Alpha/beta hydrolase fold protein  41.03 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  33.05 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  25.58 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  23.85 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  27.63 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  39.83 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0131  putative hydrolase  28.45 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  35.45 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1579  alpha/beta fold family hydrolase  26.48 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2806  alpha/beta hydrolase fold protein  27.02 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.645937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  24.53 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1166  alpha/beta hydrolase fold protein  23.33 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  32.86 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  36.44 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  27.1 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1683  hydrolase  34.78 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000746451  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  35.83 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0997  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  31.55 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  39.62 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  31.55 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  38.02 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1692  alpha/beta hydrolase fold protein  38.35 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155751 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1808  hypothetical protein  36.89 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  31.55 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2139  alpha/beta hydrolase fold protein  40.57 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.021352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.05 
 
 		 370 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1354  alpha/beta hydrolase fold  37.7 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  26.92 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  26.87 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  40.2 
 
 		 294 aa  62  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0369  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.598497 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  34.4 
 
 		 321 aa  62  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  36.3 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1121  hypothetical protein  36.11 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848062  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01343  hypothetical protein  34.82 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.08 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0519  alpha/beta hydrolase fold protein  24.9 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  33.06 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  33.06 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  35.07 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  35.07 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  36.29 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  35.07 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  33.06 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3619  putative hydrolase  39.39 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0960552  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  33.06 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  33.06 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1699  alpha/beta hydrolase fold  23.19 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  30.51 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  36.29 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1448  alpha/beta hydrolase fold  34.11 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.358742 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.92 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2898  hypothetical protein  33.08 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114451  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2986  hypothetical protein  33.08 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>