More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3943 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3943  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 		 268 aa  544  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0615663  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1894  alpha/beta hydrolase fold  97.01 
 
 		 268 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2141  alpha/beta hydrolase fold  91.42 
 
 		 268 aa  480  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0335838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3578  alpha/beta hydrolase fold  95.15 
 
 		 268 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.396236 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2310  alpha/beta hydrolase fold  70.08 
 
 		 264 aa  374  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6043  alpha/beta hydrolase fold protein  68.18 
 
 		 265 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3787  Alpha/beta hydrolase fold  63.14 
 
 		 274 aa  347  8e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2513  Alpha/beta hydrolase fold  64.31 
 
 		 276 aa  347  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3929  alpha/beta hydrolase fold  66.04 
 
 		 278 aa  344  8.999999999999999e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.419283  decreased coverage  0.00575896 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1851  alpha/beta hydrolase fold  65.04 
 
 		 283 aa  326  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0215  alpha/beta family hydrolase  61.17 
 
 		 274 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00842638  normal  0.87662 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4284  alpha/beta hydrolase fold protein  56.27 
 
 		 268 aa  296  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3485  alpha/beta hydrolase fold  57.35 
 
 		 276 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4549  alpha/beta hydrolase fold  58.82 
 
 		 276 aa  276  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.565674  normal  0.972542 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4326  alpha/beta hydrolase fold  58.09 
 
 		 276 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.703871  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4040  alpha/beta hydrolase fold  58.09 
 
 		 276 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 		 275 aa  106  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3478  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 		 295 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  29.06 
 
 		 275 aa  87.8  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1647  alpha/beta hydrolase fold protein  29.74 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4072  alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.523651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  35.25 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  37.69 
 
 		 299 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  37.69 
 
 		 299 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  34.78 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  27.3 
 
 		 284 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  26.46 
 
 		 267 aa  67  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  24.16 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1517  alpha/beta hydrolase fold protein  21.54 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00660  Alpha/beta hydrolase fold protein  39.32 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  35.59 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  36.97 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0987  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.460826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  35.04 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  35.04 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  23.99 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  23.28 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  35.9 
 
 		 287 aa  62.4  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1970  alpha/beta hydrolase fold  25.65 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000319634  normal  0.0578642 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  21.86 
 
 		 253 aa  62  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  35.96 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0650  alpha/beta hydrolase fold  24.57 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477317  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1121  hypothetical protein  24.17 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848062  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  36.44 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0369  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.598497 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  33.05 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4478  alpha/beta hydrolase fold  36.27 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  35.45 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  32.48 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  38.32 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2728  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal  0.292016 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  24.91 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  36.07 
 
 		 387 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  34.09 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  24.91 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  32.84 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0564  alpha/beta hydrolase fold  20.63 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2698  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.705965  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2742  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  29.92 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  26.57 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  36.07 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  33.06 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1579  alpha/beta fold family hydrolase  23.95 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1692  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155751 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2685  Alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.117694  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  36.21 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  29.92 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  35.54 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  33.04 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  29.92 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1065  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.289777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  34.43 
 
 		 271 aa  57  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  22.55 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  35.09 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  33.04 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4035  alpha/beta hydrolase fold protein  29.66 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.688921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  36.28 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3993  alpha/beta hydrolase fold protein  29.66 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1740  alpha/beta hydrolase fold protein  29.18 
 
 		 265 aa  57  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  33.08 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>