More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3787 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3787  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 274 aa  558  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2513  Alpha/beta hydrolase fold  97.07 
 
 		 276 aa  543  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0215  alpha/beta family hydrolase  72.53 
 
 		 274 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00842638  normal  0.87662 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3929  alpha/beta hydrolase fold  73.51 
 
 		 278 aa  395  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.419283  decreased coverage  0.00575896 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1851  alpha/beta hydrolase fold  72.39 
 
 		 283 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3485  alpha/beta hydrolase fold  69.49 
 
 		 276 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4326  alpha/beta hydrolase fold  69.12 
 
 		 276 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.703871  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4040  alpha/beta hydrolase fold  69.12 
 
 		 276 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2141  alpha/beta hydrolase fold  65.69 
 
 		 268 aa  351  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0335838 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4549  alpha/beta hydrolase fold  70.22 
 
 		 276 aa  347  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.565674  normal  0.972542 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6043  alpha/beta hydrolase fold protein  62.83 
 
 		 265 aa  339  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17046  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3943  alpha/beta fold family hydrolase  63.14 
 
 		 268 aa  332  3e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0615663  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1894  alpha/beta hydrolase fold  62.77 
 
 		 268 aa  328  8e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3578  alpha/beta hydrolase fold  63.87 
 
 		 268 aa  322  3e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.396236 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2310  alpha/beta hydrolase fold  59.48 
 
 		 264 aa  320  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4284  alpha/beta hydrolase fold protein  54.58 
 
 		 268 aa  305  5.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 		 275 aa  99.4  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3478  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  29.75 
 
 		 275 aa  92.4  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 		 267 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  36.96 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  36.96 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  26.46 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  26.04 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  26.46 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  28.11 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 		 270 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1579  alpha/beta fold family hydrolase  24.03 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  26.82 
 
 		 267 aa  72  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 		 288 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00660  Alpha/beta hydrolase fold protein  35.77 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0519  alpha/beta hydrolase fold protein  26.42 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  24.63 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  27.8 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  25.77 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  21.48 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  21.48 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  26.91 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  25.3 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  26.52 
 
 		 387 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4478  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 		 317 aa  68.9  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  25.2 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  23.78 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  26.09 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  26.09 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  26.55 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 		 268 aa  68.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4072  alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.523651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  24.64 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  36.29 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1154  hydrolase, alpha/beta fold family  26.82 
 
 		 259 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1071  alpha/beta hydrolase fold protein  29.5 
 
 		 265 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  23.85 
 
 		 300 aa  67  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  29.57 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  26.25 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  23.05 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0987  alpha/beta hydrolase fold  26.11 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.460826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  29.57 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0369  alpha/beta hydrolase fold protein  27.94 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.598497 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1453  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1728  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 294 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.0268844 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3121  hypothetical protein  24.32 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000331929  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  25.36 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  25.87 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0650  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477317  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  26.77 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  39.53 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1683  hydrolase  24.02 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000746451  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  24.29 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  23.61 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  28.07 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  24.29 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3194  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0270844 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  28.45 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  24.64 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  27.83 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  27.37 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  24.64 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  34.38 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  26.39 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  26.39 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  26.39 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1699  alpha/beta hydrolase fold  22.95 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  26.39 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  26.52 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4320  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.194736 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>