More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2141 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2141  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 268 aa  547  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0335838 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3943  alpha/beta fold family hydrolase  91.42 
 
 		 268 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0615663  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1894  alpha/beta hydrolase fold  90.3 
 
 		 268 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3578  alpha/beta hydrolase fold  92.16 
 
 		 268 aa  457  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.396236 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2310  alpha/beta hydrolase fold  71.48 
 
 		 264 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6043  alpha/beta hydrolase fold protein  68.32 
 
 		 265 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3787  Alpha/beta hydrolase fold  65.69 
 
 		 274 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2513  Alpha/beta hydrolase fold  65.93 
 
 		 276 aa  363  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3929  alpha/beta hydrolase fold  65.8 
 
 		 278 aa  348  4e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.419283  decreased coverage  0.00575896 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1851  alpha/beta hydrolase fold  65.92 
 
 		 283 aa  334  9e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0215  alpha/beta family hydrolase  62.64 
 
 		 274 aa  323  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00842638  normal  0.87662 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4284  alpha/beta hydrolase fold protein  57.41 
 
 		 268 aa  308  8e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3485  alpha/beta hydrolase fold  59.19 
 
 		 276 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4326  alpha/beta hydrolase fold  59.93 
 
 		 276 aa  292  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.703871  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4040  alpha/beta hydrolase fold  59.93 
 
 		 276 aa  292  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4549  alpha/beta hydrolase fold  59.93 
 
 		 276 aa  288  8e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.565674  normal  0.972542 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 		 275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3478  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  29.81 
 
 		 275 aa  94.7  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1647  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 		 276 aa  89  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4072  alpha/beta hydrolase fold  30.69 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.523651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  39.23 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  39.23 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  29.08 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  34.43 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  36.97 
 
 		 290 aa  68.6  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  26.85 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  36.75 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  36.52 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  36.75 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  36.75 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  36.75 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  26.86 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  33.91 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  34.92 
 
 		 321 aa  67  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1517  alpha/beta hydrolase fold protein  20.31 
 
 		 275 aa  67  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  41.12 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00660  Alpha/beta hydrolase fold protein  39.32 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  25.86 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  34.53 
 
 		 302 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  24.63 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  26.84 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  24.43 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0987  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.460826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  24.52 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  25.21 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  26.32 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  35.25 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  36.84 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  26.32 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1692  alpha/beta hydrolase fold protein  36.43 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155751 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  35.48 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1217  alpha/beta hydrolase fold protein  23.62 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4478  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1970  alpha/beta hydrolase fold  23.97 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000319634  normal  0.0578642 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  38.74 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1065  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.289777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  24.63 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  36.07 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  24.64 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  29.63 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  37.17 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  34.68 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0535  alpha/beta hydrolase fold  34.09 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  24.73 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  26.94 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  26.24 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  37.07 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  36.29 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  20.65 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0564  alpha/beta hydrolase fold  20.39 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0650  alpha/beta hydrolase fold  24.07 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477317  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  26.52 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  23.88 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  26.95 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  37.74 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5248  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  35.54 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  26.71 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  26.52 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  33.93 
 
 		 340 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  33.93 
 
 		 340 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  33.93 
 
 		 340 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1740  alpha/beta hydrolase fold protein  29.05 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  25.57 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>