More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1517 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1517  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 275 aa  567  1e-160  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0564  alpha/beta hydrolase fold  46.52 
 
 		 281 aa  269  4e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2070  putative alpha/beta hydrolase fold precursor  35.38 
 
 		 279 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0615  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 		 308 aa  113  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494418 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1667  alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 		 305 aa  105  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0987  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 		 312 aa  99  7e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.460826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3185  alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 		 296 aa  89  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  24.87 
 
 		 273 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  24.1 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6043  alpha/beta hydrolase fold protein  22.44 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  24.08 
 
 		 278 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  21.96 
 
 		 310 aa  67  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  35.51 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  32.67 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25921  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  28.71 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4516  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.320967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2141  alpha/beta hydrolase fold  20.31 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0335838 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1894  alpha/beta hydrolase fold  21.92 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3943  alpha/beta fold family hydrolase  21.54 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0615663  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  22.27 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3781  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.668878  normal  0.527561 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1691  hypothetical protein  35.64 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.517276  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  21.07 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.41 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  31.86 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3600  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3929  alpha/beta hydrolase fold  22.36 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.419283  decreased coverage  0.00575896 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  23.53 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1174  alpha/beta fold family hydrolase  37.74 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  21.49 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  28.44 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  20.66 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  21.07 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3102  Alpha/beta hydrolase fold  25.66 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.6937 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1226  alpha/beta hydrolase fold protein  28.43 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00330311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  23.53 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 405 aa  59.3  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  23.53 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  23.53 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2290  bioH protein  24.75 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  30.91 
 
 		 314 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0387  alpha/beta hydrolase fold  24.88 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  24.27 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.19 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.33 
 
 		 370 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  24 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  24 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  22.79 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  27.62 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20491  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  36.79 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.79696 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  21.7 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  20.66 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  25.53 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.13 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  22.22 
 
 		 462 aa  57  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  20 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  26.45 
 
 		 274 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0156  bioH protein  23.9 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17861  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  44.3 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  21.43 
 
 		 456 aa  57  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3496  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 267 aa  57  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.094698 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  29.73 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  27.97 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  23.5 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  23.88 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  22.01 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  23.39 
 
 		 372 aa  56.2  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  20.75 
 
 		 380 aa  55.8  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0266  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0276  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.984165  normal  0.165849 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0256  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3673 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18381  alpha/beta fold family hydrolase  30.58 
 
 		 304 aa  55.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 		 345 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0853  hypothetical protein  32.08 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000437553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  25.73 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3024  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 273 aa  55.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  hitchhiker  0.00214769 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.91 
 
 		 371 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3071  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 		 290 aa  55.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.357729  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  23.65 
 
 		 562 aa  55.5  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3630  bioH protein  23.15 
 
 		 259 aa  54.7  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  22.55 
 
 		 299 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.91 
 
 		 371 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  23.38 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2307  alpha/beta hydrolase fold protein  30.28 
 
 		 297 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.960741 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  25.49 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.91 
 
 		 371 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  30.4 
 
 		 350 aa  54.3  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2256  alpha/beta hydrolase fold protein  30.28 
 
 		 297 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  26.47 
 
 		 264 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 		 302 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0176  carboxylesterase  24.39 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2404  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367269 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  24.14 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0801  alpha/beta hydrolase fold protein  24.07 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>