More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0564 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0564  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 281 aa  581  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1517  alpha/beta hydrolase fold protein  46.52 
 
 		 275 aa  269  4e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2070  putative alpha/beta hydrolase fold precursor  32 
 
 		 279 aa  168  8e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1667  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0615  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494418 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0987  alpha/beta hydrolase fold  23.29 
 
 		 312 aa  103  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.460826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3185  alpha/beta hydrolase fold  24.4 
 
 		 296 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  24.11 
 
 		 278 aa  82  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  24.11 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  24.05 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  25.37 
 
 		 317 aa  68.9  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  32.14 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2290  bioH protein  22.69 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  19.42 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  20.53 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  22.08 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0565  alpha/beta hydrolase fold protein  30.83 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.441314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001876  biotin synthesis protein BioH  21.24 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  27.45 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  26.89 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  23.98 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2090  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0156  bioH protein  22.17 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2054  alpha/beta hydrolase fold  25.79 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0866141  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4294  alpha/beta hydrolase fold protein  20.39 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  23.02 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  33.33 
 
 		 253 aa  58.9  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1894  alpha/beta hydrolase fold  21.03 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0675  alpha/beta hydrolase fold  27.93 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0467323 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4013  bioH protein  23.04 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.96 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  23.3 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2141  alpha/beta hydrolase fold  20.39 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0335838 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2513  Alpha/beta hydrolase fold  17.96 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1701  alpha/beta hydrolase fold protein  26.32 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3943  alpha/beta fold family hydrolase  20.63 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0615663  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3787  Alpha/beta hydrolase fold  18.37 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0242  bioH protein  22.69 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2775  alpha/beta hydrolase fold protein  22.98 
 
 		 621 aa  55.8  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  24.27 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  23.76 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4069  alpha/beta hydrolase fold  20.74 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000534337 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  21.8 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  29.73 
 
 		 264 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1726  alpha/beta hydrolase fold protein  25.44 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0608  alpha/beta hydrolase fold  29.36 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000717376  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0778  alpha/beta hydrolase fold  23.96 
 
 		 290 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.588108  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3702  2-succinyl-6-hydroxy-2, 4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase  21.12 
 
 		 274 aa  55.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 		 340 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3402  esterase/lipase  32.97 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6440  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 		 268 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 		 340 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2310  alpha/beta hydrolase fold  20.63 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 		 340 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4368  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000918416  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  24.3 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  21.24 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0176  carboxylesterase  22.71 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  29.36 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  27.36 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  24.4 
 
 		 437 aa  54.3  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  23.74 
 
 		 269 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  22.64 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  25.83 
 
 		 562 aa  54.7  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  24.37 
 
 		 340 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  24.04 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  26.53 
 
 		 340 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6043  alpha/beta hydrolase fold protein  19.44 
 
 		 265 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1691  hypothetical protein  25.41 
 
 		 299 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.517276  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0445  triacylglycerol lipase  35.58 
 
 		 265 aa  53.9  0.000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.193973  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3793  carboxylesterase BioH  22.29 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4421  alpha/beta hydrolase fold protein  28.37 
 
 		 299 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4206  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.381827  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0062  alpha/beta hydrolase fold protein  25.86 
 
 		 301 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4272  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.328456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  22.12 
 
 		 290 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4433  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.27 
 
 		 372 aa  53.5  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1226  alpha/beta hydrolase fold protein  24.74 
 
 		 292 aa  53.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00330311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 		 281 aa  53.5  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  25.47 
 
 		 265 aa  53.5  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3693  carboxylesterase BioH  21.66 
 
 		 256 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  21.05 
 
 		 270 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1307  alpha/beta hydrolase fold protein  22.46 
 
 		 259 aa  53.5  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.365456  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03264  carboxylesterase of pimeloyl-CoA synthesis  21.66 
 
 		 256 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0414554  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0301  carboxylesterase BioH  21.66 
 
 		 256 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0475202 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03216  hypothetical protein  21.66 
 
 		 256 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0353415  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3609  carboxylesterase BioH  21.66 
 
 		 256 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0301  bioH protein  21.66 
 
 		 256 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100907  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3887  carboxylesterase BioH  21.66 
 
 		 256 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.840174  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00616  biotin biosynthesis protein BioH  22.28 
 
 		 254 aa  52.8  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4719  carboxylesterase BioH  21.66 
 
 		 256 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2242  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 301 aa  52.8  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.545637  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3781  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 293 aa  52.4  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.668878  normal  0.527561 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  23.02 
 
 		 314 aa  52.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  23.49 
 
 		 279 aa  52.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1128  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 256 aa  52.4  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>