More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2120 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
437 aa  897    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3950  alpha/beta hydrolase fold  32.27 
 
 
474 aa  216  8e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  31.04 
 
 
504 aa  197  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  28.01 
 
 
339 aa  93.6  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 
286 aa  92.8  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27 
 
 
285 aa  92.8  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1793  alpha/beta hydrolase fold protein  29.28 
 
 
291 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000234271  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1765  alpha/beta hydrolase fold protein  29.28 
 
 
291 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 
296 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
311 aa  87.4  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 
311 aa  86.7  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  28.52 
 
 
315 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 
309 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  28.52 
 
 
315 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3158  alpha/beta hydrolase fold protein  29.05 
 
 
290 aa  83.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
350 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 
281 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  27.57 
 
 
261 aa  82.4  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  25.93 
 
 
462 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  26.57 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 
315 aa  79.7  0.00000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  25.9 
 
 
308 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4095  alpha/beta fold family hydrolase  25.69 
 
 
294 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787751  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  24.53 
 
 
288 aa  78.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4429  hydrolase, alpha/beta fold family  25.69 
 
 
294 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0847  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 
404 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.159023 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4246  alpha/beta fold family hydrolase  25.69 
 
 
294 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000956714  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4084  alpha/beta fold family hydrolase  25.69 
 
 
294 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000349067  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  27.14 
 
 
299 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4577  alpha/beta fold family hydrolase  25.69 
 
 
287 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4481  hydrolase, alpha/beta fold family  26.55 
 
 
294 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  23.13 
 
 
314 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 
256 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4468  hydrolase, alpha/beta fold family  25.09 
 
 
294 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3757  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  29.28 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4919  alpha/beta hydrolase fold protein  27.92 
 
 
284 aa  77.4  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582438  normal  0.155895 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1801  alpha/beta hydrolase fold  25.59 
 
 
254 aa  77  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  25.97 
 
 
291 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  26.16 
 
 
301 aa  77  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 
283 aa  77  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
361 aa  77  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0769  hydrolase, alpha/beta fold family  26.09 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000479635  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  23.05 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4430  alpha/beta fold family hydrolase  26.55 
 
 
287 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 
271 aa  76.6  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3048  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 
331 aa  76.6  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.685817  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 
240 aa  75.9  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  26.55 
 
 
462 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4196  alpha/beta hydrolase fold  24.64 
 
 
294 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  26.19 
 
 
345 aa  75.1  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0608  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 
311 aa  75.1  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000717376  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4708  Alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 
295 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00337944  normal  0.50622 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  25.18 
 
 
290 aa  75.1  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  26.88 
 
 
268 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  26.77 
 
 
286 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  25.67 
 
 
341 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  24.24 
 
 
263 aa  74.7  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  22.73 
 
 
312 aa  73.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  28.22 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3023  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299925 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
279 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3071  alpha/beta hydrolase fold  22.83 
 
 
290 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.357729  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3537  hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  24.66 
 
 
364 aa  72.4  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0692853  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.56 
 
 
374 aa  72.4  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 
294 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  28.57 
 
 
279 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  28.57 
 
 
279 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  28.57 
 
 
279 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  23.25 
 
 
300 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
279 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  29.05 
 
 
279 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  28.57 
 
 
279 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2284  2-hydroxy-6-oxohepta-24-dienoate hydrolase  25.56 
 
 
303 aa  72  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.29683  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  26.07 
 
 
285 aa  72  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 
272 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  26.35 
 
 
302 aa  72  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  24.41 
 
 
253 aa  72  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 
295 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  26.02 
 
 
350 aa  72.4  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  26.09 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  25.96 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2551  Alpha/beta hydrolase fold  26.76 
 
 
341 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  25.47 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  25.39 
 
 
246 aa  70.5  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
282 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  26.34 
 
 
562 aa  70.1  0.00000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  25.45 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2433  hypothetical protein  24.5 
 
 
306 aa  70.1  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  22.88 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  27.57 
 
 
279 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  39.83 
 
 
250 aa  69.3  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  21.75 
 
 
300 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0824  hypothetical protein  23.81 
 
 
252 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.668362 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2242  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 
301 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.545637  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  21.75 
 
 
300 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2090  bromoperoxidase  28.3 
 
 
278 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 
346 aa  68.6  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>