More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0266 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0266  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
313 aa  636    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0256  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
313 aa  636    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.3673 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0276  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
313 aa  636    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.984165  normal  0.165849 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0736  alpha/beta hydrolase fold  64.14 
 
 
297 aa  393  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.467787  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  45.67 
 
 
294 aa  255  7e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  44.48 
 
 
308 aa  253  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2055  alpha/beta hydrolase fold  36.27 
 
 
322 aa  193  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000011604 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1333  hypothetical protein  38.41 
 
 
295 aa  188  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2541  alpha/beta hydrolase fold  35.05 
 
 
315 aa  166  5e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656172  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0888  alpha/beta hydrolase fold  35.55 
 
 
307 aa  159  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109453  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6816  alpha/beta hydrolase fold  35.4 
 
 
282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2094  alpha/beta hydrolase fold  32.54 
 
 
323 aa  144  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.672457  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2022  alpha/beta hydrolase fold  31.68 
 
 
321 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.560184  normal  0.215859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1744  alpha/beta hydrolase fold  35.74 
 
 
318 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
289 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  28.57 
 
 
285 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 
300 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  38.66 
 
 
229 aa  70.9  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  34.35 
 
 
359 aa  69.3  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  34.06 
 
 
302 aa  68.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  36.07 
 
 
315 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  36.07 
 
 
315 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4953  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
360 aa  67.4  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  35.25 
 
 
297 aa  67  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 
327 aa  67  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  32.37 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  30.58 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  34.91 
 
 
311 aa  65.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  30.3 
 
 
301 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  32.37 
 
 
302 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  30.99 
 
 
350 aa  63.9  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  28.84 
 
 
289 aa  64.3  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  30.41 
 
 
312 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  34.65 
 
 
302 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  37.25 
 
 
361 aa  63.2  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  35.58 
 
 
350 aa  62.8  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  34.95 
 
 
341 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  34.65 
 
 
340 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  34.65 
 
 
340 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  34.65 
 
 
340 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  32.71 
 
 
282 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  26.13 
 
 
290 aa  61.6  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  24.3 
 
 
262 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.45 
 
 
380 aa  61.6  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0565  alpha/beta hydrolase fold protein  30.89 
 
 
270 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.441314  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1408  hypothetical protein  20.14 
 
 
283 aa  60.5  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1788  hydrolase or acyltransferase  29.82 
 
 
258 aa  60.5  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000680312  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  36.13 
 
 
304 aa  60.1  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  25.62 
 
 
267 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  33.66 
 
 
340 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 
258 aa  59.7  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 
275 aa  59.7  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  25.88 
 
 
278 aa  59.3  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3669  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 
306 aa  59.3  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  34.31 
 
 
333 aa  59.3  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  31.88 
 
 
258 aa  58.9  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  21.59 
 
 
262 aa  58.5  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  32.5 
 
 
294 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4458  alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 
302 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  32.28 
 
 
321 aa  58.9  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 
306 aa  58.9  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1755  hydrolase or acyltransferase  30.77 
 
 
258 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.639278  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2728  alpha/beta hydrolase fold  28.92 
 
 
271 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190242  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  29.17 
 
 
581 aa  57.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3642  alpha/beta fold family hydrolase  30.08 
 
 
262 aa  58.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4516  alpha/beta hydrolase fold  34 
 
 
310 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.320967  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1776  hypothetical protein  30.77 
 
 
258 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274205  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1914  hypothetical protein  30.77 
 
 
258 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0234927  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3071  alpha/beta hydrolase fold  24.17 
 
 
290 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.357729  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 
295 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  19.86 
 
 
282 aa  57  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2165  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 
255 aa  57  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1155  alpha/beta hydrolase fold protein  35.1 
 
 
292 aa  57  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1517  alpha/beta hydrolase fold protein  27.03 
 
 
275 aa  57  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  34.55 
 
 
322 aa  57  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3251  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 
292 aa  56.6  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0874027  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  33 
 
 
317 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  24.04 
 
 
291 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 
257 aa  56.2  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  27.83 
 
 
279 aa  56.2  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04395  hydrolase, alpha/beta fold family protein  30.53 
 
 
263 aa  56.2  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.681804  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 
340 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  24.04 
 
 
291 aa  56.2  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1827  hydrolase  35.51 
 
 
270 aa  56.2  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2705  alpha/beta hydrolase fold  34.11 
 
 
305 aa  55.8  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  24.04 
 
 
290 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  27.14 
 
 
571 aa  55.8  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  32.11 
 
 
314 aa  55.8  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  24.04 
 
 
291 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 
270 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  24.04 
 
 
291 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  30.48 
 
 
296 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  30.63 
 
 
309 aa  55.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  29.31 
 
 
259 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  24.04 
 
 
291 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  30.63 
 
 
268 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4391  short chain dehydrogenase  47.17 
 
 
618 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.21601 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 
309 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  24.3 
 
 
264 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 
257 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>