More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3929 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3929  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
278 aa  560  1e-158  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.419283  decreased coverage  0.00575896 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1851  alpha/beta hydrolase fold  91.88 
 
 
283 aa  481  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2513  Alpha/beta hydrolase fold  73.16 
 
 
276 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3787  Alpha/beta hydrolase fold  73.51 
 
 
274 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0215  alpha/beta family hydrolase  68.01 
 
 
274 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00842638  normal  0.87662 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3485  alpha/beta hydrolase fold  67.03 
 
 
276 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6043  alpha/beta hydrolase fold protein  64.68 
 
 
265 aa  340  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17046  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2141  alpha/beta hydrolase fold  65.8 
 
 
268 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0335838 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4326  alpha/beta hydrolase fold  67.4 
 
 
276 aa  335  5e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.703871  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4040  alpha/beta hydrolase fold  67.4 
 
 
276 aa  335  5e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103708  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3943  alpha/beta fold family hydrolase  66.04 
 
 
268 aa  332  5e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0615663  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4549  alpha/beta hydrolase fold  69.23 
 
 
276 aa  329  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.565674  normal  0.972542 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3578  alpha/beta hydrolase fold  67.54 
 
 
268 aa  328  7e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.396236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1894  alpha/beta hydrolase fold  65.3 
 
 
268 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2310  alpha/beta hydrolase fold  61.94 
 
 
264 aa  321  9.000000000000001e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4284  alpha/beta hydrolase fold protein  54.95 
 
 
268 aa  291  6e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 
275 aa  90.5  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3478  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 
295 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  29.25 
 
 
267 aa  84  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  29.14 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4072  alpha/beta hydrolase fold  34.42 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.523651  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 
291 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 
291 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 
291 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 
287 aa  75.9  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  28.07 
 
 
291 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 
288 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1579  alpha/beta fold family hydrolase  26.12 
 
 
265 aa  74.7  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 
268 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  29.25 
 
 
288 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  42.03 
 
 
299 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  42.03 
 
 
299 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00660  Alpha/beta hydrolase fold protein  40.65 
 
 
280 aa  73.2  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 
387 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  21.91 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  29.23 
 
 
274 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  26.54 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1647  alpha/beta hydrolase fold protein  29.54 
 
 
276 aa  69.7  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  38.4 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  28.76 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  26.74 
 
 
387 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  27.35 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  21.55 
 
 
282 aa  68.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 
387 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  33.59 
 
 
288 aa  68.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 
381 aa  67.4  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  30.98 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  37.9 
 
 
271 aa  67  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  38.61 
 
 
295 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  24.22 
 
 
267 aa  67  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  29.92 
 
 
301 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 
294 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  25.55 
 
 
387 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  23.84 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4478  alpha/beta hydrolase fold  35.85 
 
 
317 aa  65.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0319  hypothetical protein  27.27 
 
 
255 aa  65.5  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2986  hypothetical protein  27.27 
 
 
255 aa  65.5  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33197  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  33.9 
 
 
255 aa  65.5  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0650  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 
307 aa  65.5  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477317  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 
273 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3527  alpha/beta hydrolase fold protein  30.58 
 
 
294 aa  65.1  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2898  hypothetical protein  27.27 
 
 
255 aa  65.1  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114451  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  26.74 
 
 
263 aa  65.1  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0987  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
312 aa  65.5  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.460826  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  29.05 
 
 
288 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  28.52 
 
 
262 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2939  Alpha/beta hydrolase  29.26 
 
 
345 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  25 
 
 
268 aa  64.3  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  33.58 
 
 
303 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 
280 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  27.45 
 
 
282 aa  63.9  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1580  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 
368 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.541417  normal  0.0105004 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1121  hypothetical protein  35.14 
 
 
260 aa  63.9  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848062  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  28.52 
 
 
265 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  30.43 
 
 
300 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  28.39 
 
 
260 aa  63.5  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  28.39 
 
 
260 aa  63.5  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 
272 aa  63.5  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1448  alpha/beta hydrolase fold  33.73 
 
 
294 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.358742 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  24.12 
 
 
265 aa  63.2  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 
267 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  28.3 
 
 
257 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0503  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 
292 aa  63.2  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988269  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  37.29 
 
 
346 aa  63.2  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  30.43 
 
 
300 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  37.62 
 
 
297 aa  63.2  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  26.38 
 
 
284 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  27.1 
 
 
292 aa  62.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  29.57 
 
 
300 aa  62.4  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0315  alpha/beta hydrolase fold  27.85 
 
 
300 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 
291 aa  62.4  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0515  alpha/beta hydrolase fold  36.63 
 
 
290 aa  62.4  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  29.57 
 
 
300 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1692  alpha/beta hydrolase fold protein  41.28 
 
 
239 aa  62  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.155751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  30.89 
 
 
311 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3194  alpha/beta hydrolase fold  25.58 
 
 
309 aa  62  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0270844 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3132  alpha/beta hydrolase fold protein  29.63 
 
 
344 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>