142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1740 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1740  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
265 aa  526  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3034  alpha/beta hydrolase fold  55.98 
 
 
266 aa  256  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3108  alpha/beta hydrolase fold  53.28 
 
 
280 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161436  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2996  alpha/beta hydrolase fold-1  47.69 
 
 
263 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1407  alpha/beta hydrolase fold protein  44.7 
 
 
263 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4134  hydrolase  44.15 
 
 
296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0205573  normal  0.0244334 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4287  alpha/beta hydrolase fold  42.37 
 
 
269 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2443  hydrolase  43.36 
 
 
271 aa  178  7e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.788675  normal  0.130051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0431  alpha/beta hydrolase fold-1 protein  41.2 
 
 
271 aa  175  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664922  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8266  alpha/beta hydrolase fold-1  43.08 
 
 
267 aa  169  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0277486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5385  alpha/beta hydrolase fold protein  43.17 
 
 
278 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0167566  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5036  alpha/beta hydrolase fold-1  44.11 
 
 
251 aa  159  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4939  alpha/beta hydrolase fold  35.2 
 
 
278 aa  152  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.1422  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1733  alpha/beta hydrolase fold protein  39.38 
 
 
284 aa  152  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.120461  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5301  alpha/beta hydrolase fold  39.92 
 
 
275 aa  143  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0411454  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3309  alpha/beta hydrolase fold protein-1  39.61 
 
 
267 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8363  hypothetical protein  36.5 
 
 
270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1116  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.48 
 
 
434 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0320317  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3881  alpha/beta hydrolase fold protein  39.37 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.138008 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2082  hypothetical protein  38.02 
 
 
267 aa  119  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.198932 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2177  hypothetical protein  34.24 
 
 
258 aa  109  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.362241  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5136  alpha/beta hydrolase fold protein  30.83 
 
 
291 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3125  Alpha/beta hydrolase fold-1  43.66 
 
 
277 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.235135  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0916  alpha/beta hydrolase fold protein  33.2 
 
 
252 aa  94  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4917  putative hydrolase  30.48 
 
 
272 aa  87.8  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491161  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1733  putative esterase/hydrolase  29.39 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  31.87 
 
 
277 aa  70.5  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1592  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121533  normal  0.0764642 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5048  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.614525  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0164  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 
303 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2695  alpha/beta hydrolase fold protein  28.73 
 
 
258 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0224945 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22060  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.96 
 
 
262 aa  61.2  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00549421  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2603  alpha/beta hydrolase fold  24.79 
 
 
276 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2657  alpha/beta hydrolase fold  24.79 
 
 
276 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5137  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 
315 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2097  hydrolase  25.29 
 
 
270 aa  57  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0204  hypothetical protein  37.36 
 
 
269 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0153  hydrolase  37.36 
 
 
278 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0161  hypothetical protein  37.36 
 
 
269 aa  55.8  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0155  alpha/beta fold family hydrolase  37.36 
 
 
269 aa  55.8  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0160  hypothetical protein  37.36 
 
 
269 aa  55.8  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0182  hypothetical protein  37.36 
 
 
269 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1274  alpha/beta hydrolase fold protein  36.84 
 
 
297 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.576034  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  23.9 
 
 
277 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1132  putative hydrolase  26.09 
 
 
285 aa  53.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96812  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5527  alpha/beta hydrolase fold  26 
 
 
307 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.563792  normal  0.509486 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2141  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 
268 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0335838 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  27.71 
 
 
273 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0343  alpha/beta fold family hydrolase  28.49 
 
 
372 aa  51.2  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1894  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 
268 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1701  alpha/beta hydrolase fold protein  23.55 
 
 
303 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  26.51 
 
 
275 aa  50.4  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3943  alpha/beta fold family hydrolase  29.18 
 
 
268 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0615663  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  41.11 
 
 
269 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  34.91 
 
 
285 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  33.89 
 
 
229 aa  50.4  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  35.92 
 
 
259 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28630  putative hydrolase  31.07 
 
 
287 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000201744 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2502  putative hydrolase  31.07 
 
 
283 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 
265 aa  50.1  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 
263 aa  49.7  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3694  ab hydrolase, alpha/beta hydrolase fold protein  31.79 
 
 
285 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.110664 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  29.72 
 
 
294 aa  49.3  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 
300 aa  49.3  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1726  alpha/beta hydrolase fold protein  23.21 
 
 
303 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0526  alpha/beta hydrolase fold protein  34.71 
 
 
280 aa  48.9  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375875  normal  0.273636 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  28.18 
 
 
264 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  30.94 
 
 
260 aa  48.1  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2073  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 
278 aa  48.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.944371  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  27.38 
 
 
626 aa  48.5  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5203  alpha/beta hydrolase fold protein  25.94 
 
 
260 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112668  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4827  alpha/beta hydrolase fold protein  37.11 
 
 
352 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.692638  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 
272 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0715  alpha/beta hydrolase fold protein  42.7 
 
 
285 aa  47.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1609  Alpha/beta hydrolase fold  24.33 
 
 
293 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5645  alpha/beta hydrolase fold protein  24.11 
 
 
273 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.530376  normal  0.570131 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0682  alpha/beta family hydrolase  25 
 
 
286 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 
284 aa  46.6  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0502  alpha/beta hydrolase fold  28.7 
 
 
263 aa  47  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2396  transcriptional regulator, LuxR family  25 
 
 
363 aa  46.6  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000296074  decreased coverage  0.0001884 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 
275 aa  46.2  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3929  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 
278 aa  46.6  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.419283  decreased coverage  0.00575896 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  25.65 
 
 
275 aa  46.6  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0093  alpha/beta hydrolase fold  37.25 
 
 
303 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1897  alpha/beta hydrolase fold  32.54 
 
 
264 aa  46.2  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.595115  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  22.85 
 
 
268 aa  46.2  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  26.35 
 
 
268 aa  46.2  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  28.48 
 
 
607 aa  46.2  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3243  alpha/beta hydrolase fold protein  31.14 
 
 
270 aa  45.8  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5639  alpha/beta hydrolase fold  44 
 
 
264 aa  45.8  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.801232 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  26.85 
 
 
264 aa  45.4  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3383  alpha/beta hydrolase fold  23.9 
 
 
284 aa  45.8  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
270 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  34.58 
 
 
250 aa  45.4  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  25.5 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1703  alpha/beta hydrolase fold  24.7 
 
 
502 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  27.47 
 
 
256 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.27 
 
 
265 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6963  ab hydrolase, alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
282 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.108228 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6043  alpha/beta hydrolase fold protein  24.62 
 
 
265 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17046  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>