More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5203 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_5203  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
260 aa  533  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112668  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1132  putative hydrolase  81.54 
 
 
285 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96812  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5527  alpha/beta hydrolase fold  79.92 
 
 
307 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.563792  normal  0.509486 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3383  alpha/beta hydrolase fold  59.92 
 
 
284 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4356  alpha/beta hydrolase fold  59.92 
 
 
283 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0682  alpha/beta family hydrolase  59.77 
 
 
286 aa  326  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0304  Alpha/beta hydrolase  58.59 
 
 
283 aa  319  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1609  Alpha/beta hydrolase fold  58.69 
 
 
293 aa  317  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4694  alpha/beta hydrolase fold  59.77 
 
 
283 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6598  alpha/beta hydrolase fold protein  57.36 
 
 
283 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4924  alpha/beta hydrolase fold  58.98 
 
 
283 aa  310  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5225  alpha/beta hydrolase fold  58.59 
 
 
283 aa  308  4e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3020  alpha/beta hydrolase fold  58.2 
 
 
283 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5346  alpha/beta hydrolase fold  58.2 
 
 
283 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00669533  normal  0.437988 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2502  putative hydrolase  42.53 
 
 
283 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28630  putative hydrolase  42.53 
 
 
287 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000201744 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2533  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 
394 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  hitchhiker  0.000713201 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1813  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
287 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.557453  normal  0.0116174 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1592  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 
267 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121533  normal  0.0764642 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  30.12 
 
 
263 aa  89.7  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03123  hydrolase protein  29.57 
 
 
279 aa  88.6  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 
300 aa  88.6  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  30.22 
 
 
265 aa  84  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
256 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 
277 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  24.62 
 
 
264 aa  80.5  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  29.48 
 
 
264 aa  80.9  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.754545  normal  0.278795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  27.51 
 
 
269 aa  79.7  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  23.37 
 
 
264 aa  76.6  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  26.37 
 
 
292 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3372  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 
294 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.771296 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  28.4 
 
 
268 aa  75.9  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 
277 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  24.21 
 
 
314 aa  75.5  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  26.05 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  26.47 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0186  alpha/beta hydrolase fold protein  25.77 
 
 
258 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 
277 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.48 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4279  alpha/beta hydrolase fold  25.65 
 
 
287 aa  72.8  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52768  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  26.87 
 
 
266 aa  72  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 
271 aa  72  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 
303 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  23.95 
 
 
562 aa  71.6  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1987  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000145275  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  27.04 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3352  alpha/beta superfamily hydrolase  26.45 
 
 
314 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0154019  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  25.94 
 
 
275 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  26.74 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3821  alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  24.25 
 
 
267 aa  69.3  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3143  alpha/beta hydrolase fold protein  29.07 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3803  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2945  alpha/beta hydrolase fold  21.18 
 
 
259 aa  68.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.238938 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  26.36 
 
 
425 aa  68.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  23.77 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1913  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000359899  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
278 aa  67  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  29.57 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2334  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000909068  hitchhiker  0.0000846948 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  26.02 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  23.25 
 
 
284 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  22.78 
 
 
270 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  22.39 
 
 
270 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0050  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  25.25 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000263931  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2054  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 
252 aa  65.1  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0866141  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  23.48 
 
 
273 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  22.48 
 
 
270 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  22.79 
 
 
259 aa  64.3  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 
271 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  23.51 
 
 
262 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  22.79 
 
 
258 aa  63.5  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2240  alpha/beta hydrolase fold protein  26.94 
 
 
258 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000309374  hitchhiker  0.000000000781643 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5639  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 
264 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.801232 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  26.35 
 
 
263 aa  63.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  23.27 
 
 
270 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  23.08 
 
 
262 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 
279 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4001  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
271 aa  62.8  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  23.55 
 
 
270 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  28.94 
 
 
269 aa  62.8  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  23.55 
 
 
270 aa  62.4  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4713  alpha/beta hydrolase fold protein  23.32 
 
 
294 aa  62.4  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.848228 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  25 
 
 
425 aa  62  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.24 
 
 
313 aa  62  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1704  alpha/beta fold family hydrolase  23.59 
 
 
262 aa  62  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000659233  normal  0.0248748 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1270  alpha/beta hydrolase fold protein  26.15 
 
 
262 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273364  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  22.73 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  23.02 
 
 
270 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4523  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  31.75 
 
 
271 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  26.07 
 
 
462 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4287  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
269 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  25.29 
 
 
265 aa  61.6  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  26.39 
 
 
278 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  23.62 
 
 
270 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  26.43 
 
 
284 aa  61.6  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  22.73 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>