118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3108 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3108  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
280 aa  551  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161436  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3034  alpha/beta hydrolase fold  87.22 
 
 
266 aa  439  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1740  alpha/beta hydrolase fold protein  53.28 
 
 
265 aa  261  6.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2996  alpha/beta hydrolase fold-1  46.99 
 
 
263 aa  193  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4134  hydrolase  45.56 
 
 
296 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0205573  normal  0.0244334 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0431  alpha/beta hydrolase fold-1 protein  43.94 
 
 
271 aa  185  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664922  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1407  alpha/beta hydrolase fold protein  42.32 
 
 
263 aa  181  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8266  alpha/beta hydrolase fold-1  43.4 
 
 
267 aa  178  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0277486 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4939  alpha/beta hydrolase fold  40.68 
 
 
278 aa  176  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.1422  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2443  hydrolase  43.46 
 
 
271 aa  172  7.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.788675  normal  0.130051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5385  alpha/beta hydrolase fold protein  44.94 
 
 
278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0167566  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3309  alpha/beta hydrolase fold protein-1  42.69 
 
 
267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5301  alpha/beta hydrolase fold  41.44 
 
 
275 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0411454  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1733  alpha/beta hydrolase fold protein  41.2 
 
 
284 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.120461  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5036  alpha/beta hydrolase fold-1  42.08 
 
 
251 aa  151  8.999999999999999e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4287  alpha/beta hydrolase fold  36.43 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2177  hypothetical protein  39.54 
 
 
258 aa  145  8.000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.362241  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1116  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.4 
 
 
434 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0320317  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8363  hypothetical protein  35.02 
 
 
270 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2082  hypothetical protein  36.67 
 
 
267 aa  125  8.000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.198932 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3881  alpha/beta hydrolase fold protein  37.55 
 
 
268 aa  110  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.138008 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3125  Alpha/beta hydrolase fold-1  42.59 
 
 
277 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.235135  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0916  alpha/beta hydrolase fold protein  35.46 
 
 
252 aa  103  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5136  alpha/beta hydrolase fold protein  31.5 
 
 
291 aa  95.1  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1733  putative esterase/hydrolase  26.96 
 
 
295 aa  86.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4917  putative hydrolase  32.23 
 
 
272 aa  83.6  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491161  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5048  alpha/beta hydrolase fold protein  30.68 
 
 
279 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.614525  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 
277 aa  70.1  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2695  alpha/beta hydrolase fold protein  30.94 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0224945 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2097  hydrolase  26.36 
 
 
270 aa  60.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0326  alpha/beta fold family hydrolase  26.41 
 
 
267 aa  60.1  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.339818  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1592  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
267 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121533  normal  0.0764642 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0328  alpha/beta hydrolase fold protein  38.46 
 
 
284 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3841  alpha/beta hydrolase fold  30.67 
 
 
267 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.819174  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5269  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 
287 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
300 aa  52.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4731  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
287 aa  52.8  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  30.65 
 
 
265 aa  52.4  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  24.6 
 
 
264 aa  52.4  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3966  alpha/beta hydrolase fold  30.67 
 
 
267 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2603  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 
276 aa  52  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2657  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 
276 aa  52  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0163  hypothetical protein  35.19 
 
 
284 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  39.13 
 
 
229 aa  51.2  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0343  alpha/beta fold family hydrolase  34.38 
 
 
372 aa  50.8  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  22.71 
 
 
264 aa  50.4  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0164  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 
303 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4827  alpha/beta hydrolase fold protein  35.64 
 
 
352 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.692638  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  28.85 
 
 
321 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0777  alpha/beta hydrolase fold protein  36.04 
 
 
347 aa  50.4  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  26.84 
 
 
263 aa  50.1  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  29.86 
 
 
278 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1701  alpha/beta hydrolase fold protein  23.13 
 
 
303 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3768  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 
267 aa  49.7  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1046  alpha/beta hydrolase fold protein  26.86 
 
 
274 aa  48.9  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1228  alpha/beta hydrolase fold protein  25.67 
 
 
265 aa  48.9  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1659  alpha/beta hydrolase  35.51 
 
 
277 aa  48.5  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0254328  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4933  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 
362 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0299  alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 
343 aa  48.5  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0565  alpha/beta hydrolase fold protein  32.38 
 
 
270 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.441314  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1699  putative hydrolase  31.19 
 
 
312 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1726  alpha/beta hydrolase fold protein  22.79 
 
 
303 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0162  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
278 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1641  alpha/beta hydrolase fold  24.8 
 
 
317 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1894  alpha/beta hydrolase fold  39.5 
 
 
268 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  30.95 
 
 
271 aa  46.6  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 
266 aa  46.2  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  26.87 
 
 
344 aa  46.2  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1897  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 
264 aa  46.2  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.595115  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3943  alpha/beta fold family hydrolase  38.66 
 
 
268 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0615663  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  23.79 
 
 
286 aa  45.8  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 
294 aa  45.8  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0700  alpha/beta fold family hydrolase  23.16 
 
 
263 aa  45.8  0.0008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.338828  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  29.41 
 
 
260 aa  45.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0011  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase)  25.1 
 
 
317 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.903743  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  30.1 
 
 
284 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1315  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 
320 aa  45.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0924774  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1209  esterase/lipase  23.21 
 
 
311 aa  45.4  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0638  alpha/beta hydrolase fold  24.18 
 
 
262 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13227  lipase lipV  30.92 
 
 
261 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0653  alpha/beta hydrolase fold  24.18 
 
 
262 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.748775  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1763  hydrolase, alpha/beta fold family  28.74 
 
 
298 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3171  proline iminopeptidase  25.25 
 
 
298 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  31.31 
 
 
267 aa  45.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 
284 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3177  Alpha/beta hydrolase fold-1  36.46 
 
 
272 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.97494  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1147  alpha/beta hydrolase fold  23.66 
 
 
369 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255082  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1164  alpha/beta hydrolase fold  23.66 
 
 
369 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.428268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1174  alpha/beta hydrolase fold  23.66 
 
 
369 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326598  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1000  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 
285 aa  44.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000731693  hitchhiker  0.000000950161 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3040  alpha/beta fold family hydrolase  24.4 
 
 
258 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4574  alpha/beta fold family hydrolase  29.08 
 
 
266 aa  43.9  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1696  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  29.53 
 
 
307 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 
607 aa  43.9  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3062  hypothetical protein  32.14 
 
 
288 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  31.07 
 
 
284 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1813  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 
287 aa  43.5  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.557453  normal  0.0116174 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1534  lipolytic enzyme  24.64 
 
 
294 aa  43.5  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.277395  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
275 aa  43.5  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3368  alpha/beta hydrolase fold protein  35.42 
 
 
326 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>