113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5036 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5036  alpha/beta hydrolase fold-1  100 
 
 
251 aa  478  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0431  alpha/beta hydrolase fold-1 protein  45 
 
 
271 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664922  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2443  hydrolase  42.97 
 
 
271 aa  177  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.788675  normal  0.130051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4134  hydrolase  44.91 
 
 
296 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0205573  normal  0.0244334 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1740  alpha/beta hydrolase fold protein  44.11 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2996  alpha/beta hydrolase fold-1  44.44 
 
 
263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1407  alpha/beta hydrolase fold protein  40.61 
 
 
263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8266  alpha/beta hydrolase fold-1  44.27 
 
 
267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0277486 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3881  alpha/beta hydrolase fold protein  43.7 
 
 
268 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.138008 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5301  alpha/beta hydrolase fold  43.72 
 
 
275 aa  152  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0411454  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4287  alpha/beta hydrolase fold  37.07 
 
 
269 aa  151  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3034  alpha/beta hydrolase fold  42.15 
 
 
266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5385  alpha/beta hydrolase fold protein  44.58 
 
 
278 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0167566  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3309  alpha/beta hydrolase fold protein-1  40.94 
 
 
267 aa  141  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4939  alpha/beta hydrolase fold  37.66 
 
 
278 aa  136  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.1422  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2177  hypothetical protein  41.37 
 
 
258 aa  135  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.362241  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3108  alpha/beta hydrolase fold  42.08 
 
 
280 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161436  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1116  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  40.08 
 
 
434 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0320317  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8363  hypothetical protein  37.02 
 
 
270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1733  alpha/beta hydrolase fold protein  39.47 
 
 
284 aa  124  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.120461  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3125  Alpha/beta hydrolase fold-1  44.8 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.235135  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2082  hypothetical protein  40.45 
 
 
267 aa  105  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.198932 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1733  putative esterase/hydrolase  32.18 
 
 
295 aa  92  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5136  alpha/beta hydrolase fold protein  29.92 
 
 
291 aa  90.5  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2695  alpha/beta hydrolase fold protein  32.95 
 
 
258 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0224945 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0916  alpha/beta hydrolase fold protein  32.8 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9212  alpha/beta hydrolase fold protein  42.61 
 
 
283 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5048  alpha/beta hydrolase fold protein  44.55 
 
 
279 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.614525  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2603  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
276 aa  59.3  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2657  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
276 aa  59.3  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4917  putative hydrolase  40.68 
 
 
272 aa  58.5  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491161  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2097  hydrolase  28.68 
 
 
270 aa  55.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0526  alpha/beta hydrolase fold protein  37.21 
 
 
280 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375875  normal  0.273636 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 
277 aa  52.4  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4827  alpha/beta hydrolase fold protein  38.1 
 
 
352 aa  52  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.692638  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  29.71 
 
 
284 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0715  alpha/beta hydrolase fold protein  41.05 
 
 
285 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0093  alpha/beta hydrolase fold  39.39 
 
 
303 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 
300 aa  50.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1280  alpha/beta fold family hydrolase  29.9 
 
 
258 aa  49.3  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000022197  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  29.72 
 
 
284 aa  48.9  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  23.62 
 
 
264 aa  48.9  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0741  alpha/beta fold family hydrolase  29.59 
 
 
263 aa  48.5  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00132598  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2970  transcriptional regulator, CadC  39.31 
 
 
396 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0328  alpha/beta hydrolase fold protein  48.53 
 
 
284 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3075  transcriptional regulator, CadC  39.31 
 
 
396 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22060  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.42 
 
 
262 aa  48.5  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00549421  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0161  hypothetical protein  34 
 
 
269 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0153  hydrolase  34 
 
 
278 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0160  hypothetical protein  34 
 
 
269 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2882  transcriptional regulator, CadC  42.06 
 
 
396 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.405219  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1274  alpha/beta hydrolase fold protein  34.38 
 
 
297 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.576034  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 
284 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0182  hypothetical protein  34 
 
 
269 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  39.78 
 
 
264 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3694  ab hydrolase, alpha/beta hydrolase fold protein  34.96 
 
 
285 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.110664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  35.58 
 
 
258 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0155  alpha/beta fold family hydrolase  34 
 
 
269 aa  47  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  22.83 
 
 
264 aa  47  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7352  Alpha/beta hydrolase  28.4 
 
 
291 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5930  hypothetical protein  44.79 
 
 
267 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.615231  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4462  alpha/beta hydrolase fold protein  36.84 
 
 
277 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5527  alpha/beta hydrolase fold  33.01 
 
 
307 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.563792  normal  0.509486 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0204  hypothetical protein  34 
 
 
269 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0585  alpha/beta hydrolase fold  32.29 
 
 
285 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474837  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2623  alpha/beta hydrolase fold  34.41 
 
 
269 aa  45.8  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.211158  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  35.16 
 
 
260 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  43.42 
 
 
259 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5476  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 
333 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294136  normal  0.797092 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  40.59 
 
 
264 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.754545  normal  0.278795 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3219  alpha/beta hydrolase fold protein  35.87 
 
 
270 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1703  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 
502 aa  44.3  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0163  hypothetical protein  44.12 
 
 
284 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0638  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 
262 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0653  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 
262 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.748775  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3995  chloroperoxidase precursor  28.35 
 
 
276 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1592  alpha/beta hydrolase fold  32.72 
 
 
267 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121533  normal  0.0764642 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0502  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
263 aa  44.3  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  33.67 
 
 
270 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  37.37 
 
 
323 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  38.71 
 
 
269 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0078  ab hydrolase, alpha/beta hydrolase fold protein  32.99 
 
 
282 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  30.12 
 
 
258 aa  43.5  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  33.67 
 
 
270 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28630  putative hydrolase  34.69 
 
 
287 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000201744 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29020  chloroperoxidase precursor  27.56 
 
 
276 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.995557  hitchhiker  0.000198264 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0559  hypothetical protein  29.81 
 
 
277 aa  43.5  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.881778  normal  0.0430295 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2502  putative hydrolase  34.69 
 
 
283 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4392  putative dioxygenase  31.25 
 
 
262 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.537049  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5099  alpha/beta hydrolase fold protein  36.3 
 
 
277 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0565  alpha/beta hydrolase fold protein  25.84 
 
 
270 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.441314  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  32.04 
 
 
282 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0682  alpha/beta family hydrolase  29.9 
 
 
286 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4933  alpha/beta hydrolase fold  35.16 
 
 
362 aa  43.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1132  putative hydrolase  31 
 
 
285 aa  43.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96812  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1897  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 
264 aa  42.7  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.595115  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1268  hypothetical protein  39.34 
 
 
290 aa  43.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0354701  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00980  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.04 
 
 
279 aa  42.7  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 
229 aa  43.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  35.05 
 
 
304 aa  42.7  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>