More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1132 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1132  putative hydrolase  100 
 
 		 285 aa  584  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5527  alpha/beta hydrolase fold  92.59 
 
 		 307 aa  518  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.563792  normal  0.509486 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5203  alpha/beta hydrolase fold protein  81.54 
 
 		 260 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112668  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3383  alpha/beta hydrolase fold  59.18 
 
 		 284 aa  332  6e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4356  alpha/beta hydrolase fold  58.27 
 
 		 283 aa  330  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1609  Alpha/beta hydrolase fold  60 
 
 		 293 aa  329  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0682  alpha/beta family hydrolase  58.21 
 
 		 286 aa  329  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0304  Alpha/beta hydrolase  58.27 
 
 		 283 aa  328  7e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4924  alpha/beta hydrolase fold  59.4 
 
 		 283 aa  322  4e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5225  alpha/beta hydrolase fold  58.65 
 
 		 283 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4694  alpha/beta hydrolase fold  59.02 
 
 		 283 aa  319  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6598  alpha/beta hydrolase fold protein  58.11 
 
 		 283 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3020  alpha/beta hydrolase fold  58.65 
 
 		 283 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5346  alpha/beta hydrolase fold  58.65 
 
 		 283 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00669533  normal  0.437988 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28630  putative hydrolase  43.28 
 
 		 287 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000201744 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2502  putative hydrolase  42.91 
 
 		 283 aa  188  8e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2533  alpha/beta hydrolase fold  30.97 
 
 		 394 aa  113  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  hitchhiker  0.000713201 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1813  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 		 287 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.557453  normal  0.0116174 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1592  alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 		 267 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121533  normal  0.0764642 
 
 
-
 
NC_003296  RS03123  hydrolase protein  27.24 
 
 		 279 aa  91.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 		 277 aa  89.7  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  28.09 
 
 		 263 aa  87.8  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  30.37 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  26.72 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  31.06 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3372  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.771296 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 270 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  27 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  26.41 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  25.75 
 
 		 270 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  24.71 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  23.51 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  23.19 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0186  alpha/beta hydrolase fold protein  24.71 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  29.88 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.754545  normal  0.278795 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2945  alpha/beta hydrolase fold  22.35 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.238938 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 271 aa  75.5  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  26.16 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  24.92 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  23.79 
 
 		 264 aa  72.4  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  25.91 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  23.72 
 
 		 270 aa  72  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  23.23 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  25.36 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4279  alpha/beta hydrolase fold  23.64 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52768  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1913  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000359899  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  26.47 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  28.57 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3352  alpha/beta superfamily hydrolase  25.17 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0154019  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  24.21 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0050  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  23.37 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000263931  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  27.14 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  25.74 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  21.82 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  22.22 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 		 303 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  20.66 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  25.57 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  26.2 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2240  alpha/beta hydrolase fold protein  27.94 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000309374  hitchhiker  0.000000000781643 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  20.66 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 277 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  25.51 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  23.13 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  30.77 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3803  alpha/beta hydrolase fold  25.78 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  30.77 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2334  alpha/beta hydrolase fold  24.18 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000909068  hitchhiker  0.0000846948 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  22.94 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  32.73 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3821  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3143  alpha/beta hydrolase fold protein  25.66 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  19.93 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3040  alpha/beta fold family hydrolase  29.04 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  22.22 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1192  alpha/beta superfamily hydrolase  25.99 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1764  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4001  alpha/beta hydrolase fold protein  23.43 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  19.93 
 
 		 270 aa  65.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  20.74 
 
 		 270 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8516  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  35.54 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal  0.759464 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  23.99 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  25.8 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  26.12 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  26.98 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  26.09 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6084  hydrolase  28.23 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4513  hypothetical protein  27.57 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>