More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2502 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2502  putative hydrolase  100 
 
 
283 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28630  putative hydrolase  96.09 
 
 
287 aa  477  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000201744 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1609  Alpha/beta hydrolase fold  44.36 
 
 
293 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3383  alpha/beta hydrolase fold  45.11 
 
 
284 aa  215  7e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0304  Alpha/beta hydrolase  43.77 
 
 
283 aa  209  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5225  alpha/beta hydrolase fold  43.77 
 
 
283 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4924  alpha/beta hydrolase fold  44.15 
 
 
283 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4694  alpha/beta hydrolase fold  43.77 
 
 
283 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3020  alpha/beta hydrolase fold  43.4 
 
 
283 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5346  alpha/beta hydrolase fold  43.4 
 
 
283 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00669533  normal  0.437988 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1132  putative hydrolase  42.91 
 
 
285 aa  205  8e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96812  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5527  alpha/beta hydrolase fold  42.03 
 
 
307 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.563792  normal  0.509486 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0682  alpha/beta family hydrolase  42.54 
 
 
286 aa  202  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5203  alpha/beta hydrolase fold protein  42.53 
 
 
260 aa  201  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112668  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6598  alpha/beta hydrolase fold protein  42.8 
 
 
283 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4356  alpha/beta hydrolase fold  41.29 
 
 
283 aa  198  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1813  alpha/beta hydrolase fold  35.4 
 
 
287 aa  129  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.557453  normal  0.0116174 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1592  alpha/beta hydrolase fold  34.3 
 
 
267 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121533  normal  0.0764642 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2533  alpha/beta hydrolase fold  33.82 
 
 
394 aa  115  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  hitchhiker  0.000713201 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  33.81 
 
 
277 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03123  hydrolase protein  29.79 
 
 
279 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3372  alpha/beta hydrolase fold  31.83 
 
 
294 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.771296 
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  30.58 
 
 
275 aa  99.8  5e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  29.5 
 
 
275 aa  95.9  7e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 
300 aa  95.9  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  29.54 
 
 
275 aa  94  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  34.94 
 
 
264 aa  93.2  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.754545  normal  0.278795 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  32.1 
 
 
268 aa  88.6  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4279  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
287 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52768  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5645  alpha/beta hydrolase fold protein  28.95 
 
 
273 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.530376  normal  0.570131 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.94 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3821  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 
267 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2929  putative alpha/beta hydrolase  32.71 
 
 
277 aa  82  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0296814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1192  alpha/beta superfamily hydrolase  27.64 
 
 
287 aa  82  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  30.18 
 
 
263 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  29.02 
 
 
263 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1704  alpha/beta fold family hydrolase  30.22 
 
 
262 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000659233  normal  0.0248748 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  29.02 
 
 
262 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5136  alpha/beta hydrolase fold protein  27.05 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  24.82 
 
 
277 aa  79.3  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1880  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 
258 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000336147  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4287  alpha/beta hydrolase fold  25.71 
 
 
269 aa  79  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  30.99 
 
 
278 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0916  alpha/beta hydrolase fold protein  31.64 
 
 
252 aa  77  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2154  alpha/beta hydrolase fold protein  27.6 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016859 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3352  alpha/beta superfamily hydrolase  26.94 
 
 
314 aa  76.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0154019  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2033  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000295645  hitchhiker  0.000143979 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 
263 aa  75.9  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1942  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
266 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000178977  hitchhiker  0.00172948 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  28.37 
 
 
275 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2136  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 
266 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000406984  decreased coverage  0.00000741326 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 
256 aa  75.5  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  30.63 
 
 
275 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  32.03 
 
 
265 aa  74.7  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  26.1 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2194  alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 
258 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000635452  unclonable  0.000004336 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5048  alpha/beta hydrolase fold protein  28.78 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.614525  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  26.43 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2144  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 
258 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412012  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 
257 aa  73.2  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3242  alpha/beta hydrolase fold protein  29.75 
 
 
268 aa  73.2  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.988138  normal  0.0849253 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  25.51 
 
 
264 aa  73.2  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  26.86 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  31.02 
 
 
275 aa  73.2  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9212  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1589  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 
297 aa  72.8  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000678244  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4513  hypothetical protein  29.89 
 
 
258 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2227  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 
258 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000690683  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  28.16 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  26.3 
 
 
267 aa  72.4  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2333  alpha/beta fold family hydrolase  29.2 
 
 
280 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2240  alpha/beta hydrolase fold protein  29.52 
 
 
258 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000309374  hitchhiker  0.000000000781643 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2073  alpha/beta hydrolase fold  28.18 
 
 
278 aa  71.6  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.944371  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1919  alpha/beta hydrolase fold  24.83 
 
 
309 aa  72  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  27.99 
 
 
271 aa  72  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  26.04 
 
 
264 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  26.71 
 
 
425 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  25.71 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2334  alpha/beta hydrolase fold  28.84 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000909068  hitchhiker  0.0000846948 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 
278 aa  71.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  25.18 
 
 
296 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1913  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 
257 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000359899  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  26.13 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  24.65 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3436  alpha/beta hydrolase  27.55 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
261 aa  70.1  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  25.17 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  25.17 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  24.64 
 
 
264 aa  69.7  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  26.47 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  27.47 
 
 
265 aa  68.9  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  28.93 
 
 
279 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  25.46 
 
 
279 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>