More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2929 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2929  putative alpha/beta hydrolase  100 
 
 		 277 aa  540  9.999999999999999e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0296814 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3821  alpha/beta hydrolase fold  42.74 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2073  alpha/beta hydrolase fold  36.82 
 
 		 278 aa  148  7e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.944371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1055  alpha/beta hydrolase  40.66 
 
 		 239 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5645  alpha/beta hydrolase fold protein  33.73 
 
 		 273 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.530376  normal  0.570131 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  36.55 
 
 		 264 aa  102  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.754545  normal  0.278795 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1592  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121533  normal  0.0764642 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1813  alpha/beta hydrolase fold  32.21 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.557453  normal  0.0116174 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0084  alpha/beta hydrolase fold protein  28.75 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1465  alpha/beta hydrolase fold protein  32.77 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.647363  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2533  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 394 aa  72.8  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  hitchhiker  0.000713201 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  24.43 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5527  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 307 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.563792  normal  0.509486 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  28.73 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  27.8 
 
 		 281 aa  67  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 		 352 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3527  alpha/beta hydrolase fold protein  37.31 
 
 		 294 aa  67  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  28.99 
 
 		 350 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  29.13 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4154  alpha/beta hydrolase  30.56 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  26.14 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  29.72 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1609  Alpha/beta hydrolase fold  25.86 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7407  Alpha/beta hydrolase  38.14 
 
 		 274 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 		 308 aa  65.5  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  28.7 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6084  hydrolase  26.56 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2743  alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.529791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3383  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5203  alpha/beta hydrolase fold protein  25.94 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112668  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1913  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000359899  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  27.61 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  26.16 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  25.76 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  23.77 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  29 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3939  Alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5888  alpha/beta hydrolase fold  38.14 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6154  alpha/beta hydrolase fold  38.14 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  24.36 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1132  putative hydrolase  24.81 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5633  alpha/beta hydrolase fold  36.44 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5998  alpha/beta hydrolase fold  36.44 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.492767 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1703  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 		 502 aa  62.4  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0916  alpha/beta hydrolase fold protein  29.92 
 
 		 252 aa  62  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0178  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4158  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0351  alpha/beta hydrolase fold  24.52 
 
 		 275 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.347807 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6489  alpha/beta hydrolase fold  35.59 
 
 		 274 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2970  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0304  Alpha/beta hydrolase  26.04 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  31.08 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  24.26 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  24.25 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1897  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.595115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  28.51 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3669  alpha/beta hydrolase fold  38.52 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  27.46 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13227  lipase lipV  29.77 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5225  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  35.59 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  38.02 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6254  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal  0.235201 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  36.51 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2933  alpha/beta hydrolase fold  22.74 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0612634  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0886  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4694  alpha/beta hydrolase fold  25.76 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4667  alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113193  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4924  alpha/beta hydrolase fold  26.18 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  35.59 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  35.59 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  35.59 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.59 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2045  alpha/beta hydrolase fold protein  29.83 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.083987 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2502  putative hydrolase  33.09 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  35.59 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1273  Alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.879726  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0147  alpha/beta hydrolase  29.02 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  28.74 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1750  alpha/beta hydrolase fold  34.27 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99004  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0910  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.592226 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1270  alpha/beta hydrolase fold protein  23.02 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273364  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3552  alpha/beta hydrolase fold protein  30.19 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336946  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  29.26 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1800  alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155348 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0592  alpha/beta hydrolase fold  28.23 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  35.59 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>