More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3821 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3821  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 256 aa  502  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1055  alpha/beta hydrolase  41.88 
 
 		 239 aa  148  9e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2073  alpha/beta hydrolase fold  37.4 
 
 		 278 aa  145  6e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.944371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2929  putative alpha/beta hydrolase  42.74 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0296814 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5645  alpha/beta hydrolase fold protein  31.47 
 
 		 273 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.530376  normal  0.570131 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  29.57 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.754545  normal  0.278795 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2533  alpha/beta hydrolase fold  34.78 
 
 		 394 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  hitchhiker  0.000713201 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1592  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121533  normal  0.0764642 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  29.88 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1586  alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  29.15 
 
 		 282 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5203  alpha/beta hydrolase fold protein  28.98 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112668  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3436  alpha/beta hydrolase  28.81 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1813  alpha/beta hydrolase fold  32.18 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.557453  normal  0.0116174 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 282 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  30.16 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1132  putative hydrolase  27.92 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  29.02 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 305 aa  65.5  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  23.85 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0918  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.891406  normal  0.241554 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1704  alpha/beta fold family hydrolase  28.4 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000659233  normal  0.0248748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  30.16 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  26.48 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1135  putative hydrolase protein  29.37 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5527  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.563792  normal  0.509486 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  25.27 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  29.44 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  27.46 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2704  alpha/beta fold family hydrolase  31.47 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  26.97 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  24.89 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1459  alpha/beta fold family hydrolase  31.47 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1684  alpha/beta fold family hydrolase  31.47 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.163104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2625  alpha/beta fold family hydrolase  31.47 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738195  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  29.07 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3131  alpha/beta fold family hydrolase  31.47 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0821  esterase/lipase/thioesterase  28.35 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2479  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.261597 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  28 
 
 		 292 aa  62  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4154  alpha/beta hydrolase  31.89 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2186  alpha/beta fold family hydrolase  31.47 
 
 		 296 aa  62  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2571  alpha/beta fold family hydrolase  31.12 
 
 		 349 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  27.71 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  30.65 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4206  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.381827  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4433  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  38.52 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4272  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.328456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  29.44 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1065  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.289777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6084  hydrolase  29.8 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  23.08 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3298  hypothetical protein  25.76 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  29.54 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.73 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  27.89 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0064  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  23.32 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3929  alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.419283  decreased coverage  0.00575896 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  36.84 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  21.37 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  33.62 
 
 		 2762 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  22.99 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  27.85 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3391  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445153  normal  0.48468 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  36.28 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3502  alpha/beta hydrolase fold protein  27.68 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0503333  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2024  alpha/beta hydrolase fold  33 
 
 		 329 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  27.69 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  22.62 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0200  alpha/beta hydrolase fold protein  30.7 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  23.14 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4590  alpha/beta hydrolase fold protein  35.04 
 
 		 327 aa  58.9  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1935  alpha/beta fold family hydrolase  33.09 
 
 		 311 aa  58.5  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1187  putative lipase  32.43 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  23.08 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6043  alpha/beta hydrolase fold protein  29.15 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  24.42 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>