More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5527 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5527  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 307 aa  630  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.563792  normal  0.509486 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1132  putative hydrolase  92.59 
 
 		 285 aa  518  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5203  alpha/beta hydrolase fold protein  79.92 
 
 		 260 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112668  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3383  alpha/beta hydrolase fold  58.58 
 
 		 284 aa  329  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1609  Alpha/beta hydrolase fold  58.97 
 
 		 293 aa  329  4e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0682  alpha/beta family hydrolase  57.04 
 
 		 286 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4356  alpha/beta hydrolase fold  57.84 
 
 		 283 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0304  Alpha/beta hydrolase  56.78 
 
 		 283 aa  325  5e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6598  alpha/beta hydrolase fold protein  58.58 
 
 		 283 aa  324  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4924  alpha/beta hydrolase fold  57.51 
 
 		 283 aa  318  6e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3020  alpha/beta hydrolase fold  57.51 
 
 		 283 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5346  alpha/beta hydrolase fold  57.51 
 
 		 283 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00669533  normal  0.437988 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5225  alpha/beta hydrolase fold  56.78 
 
 		 283 aa  315  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4694  alpha/beta hydrolase fold  57.14 
 
 		 283 aa  315  5e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28630  putative hydrolase  42.65 
 
 		 287 aa  185  8e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000201744 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2502  putative hydrolase  42.03 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2533  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 		 394 aa  119  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  hitchhiker  0.000713201 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1813  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 		 287 aa  116  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.557453  normal  0.0116174 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  29.82 
 
 		 263 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  32.45 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1592  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121533  normal  0.0764642 
 
 
-
 
NC_003296  RS03123  hydrolase protein  27.41 
 
 		 279 aa  91.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  32.45 
 
 		 282 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  26.57 
 
 		 265 aa  87  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 		 300 aa  86.3  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  27.3 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  23.72 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  24.09 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  25.67 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0186  alpha/beta hydrolase fold protein  25.84 
 
 		 258 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  24.09 
 
 		 270 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0050  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  22.84 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000263931  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  24.09 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  24.37 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  23.83 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  23.81 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3372  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.771296 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2945  alpha/beta hydrolase fold  23.02 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.238938 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1913  alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 		 257 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000359899  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1192  alpha/beta superfamily hydrolase  25.81 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3040  alpha/beta fold family hydrolase  28.94 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  24.45 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  24.53 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2334  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000909068  hitchhiker  0.0000846948 
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  24.45 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  25.66 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  26.62 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  26.74 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  25.46 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  27.14 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3352  alpha/beta superfamily hydrolase  26.69 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0154019  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2240  alpha/beta hydrolase fold protein  26.28 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000309374  hitchhiker  0.000000000781643 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  23.74 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  26.51 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4279  alpha/beta hydrolase fold  23.4 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52768  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 		 264 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.754545  normal  0.278795 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5639  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 264 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.801232 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  34.4 
 
 		 273 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  23.81 
 
 		 258 aa  72  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  25.65 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  21.77 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  21.77 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  23.83 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4001  alpha/beta hydrolase fold protein  24.82 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  22.14 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  24.54 
 
 		 425 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1579  alpha/beta fold family hydrolase  23.21 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  26.6 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  25.27 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  28.24 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4513  hypothetical protein  25.91 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2227  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000690683  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  23.25 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2144  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 		 258 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412012  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  21.32 
 
 		 270 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  25.42 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  28.03 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  27.64 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  21.32 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  22.06 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  27.04 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1880  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000336147  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1987  alpha/beta hydrolase fold  25.55 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000145275  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  24.05 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  26.06 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  26.52 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  27.08 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1704  alpha/beta fold family hydrolase  25.64 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000659233  normal  0.0248748 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  26.47 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  28.69 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  25.5 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>