More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5639 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5639  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 264 aa  518  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.801232 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5527  alpha/beta hydrolase fold  30.27 
 
 		 307 aa  85.5  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.563792  normal  0.509486 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5203  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112668  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1132  putative hydrolase  28.02 
 
 		 285 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  31.12 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4713  alpha/beta hydrolase fold protein  28.93 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.848228 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  31.12 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1592  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121533  normal  0.0764642 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 		 277 aa  68.9  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  31.14 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2533  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 394 aa  65.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  hitchhiker  0.000713201 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1813  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 287 aa  65.5  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.557453  normal  0.0116174 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  29.76 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  21.21 
 
 		 571 aa  60.5  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  29.78 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 		 332 aa  57  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  40.18 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  34.5 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4287  alpha/beta hydrolase fold  22.36 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  37.04 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5417  alpha/beta fold family hydrolase  39.09 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  30.23 
 
 		 226 aa  54.3  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1740  alpha/beta hydrolase fold protein  30.7 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1047  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.975256  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3365  alpha/beta hydrolase fold  36.67 
 
 		 265 aa  53.9  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.6363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 		 267 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1825  alpha/beta hydrolase fold  35.4 
 
 		 243 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388616  normal  0.284005 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1055  alpha/beta hydrolase  30.3 
 
 		 239 aa  53.1  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  36 
 
 		 284 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 		 339 aa  53.1  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1418  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 		 276 aa  53.1  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.961025  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  29.1 
 
 		 284 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  32.24 
 
 		 265 aa  53.1  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03123  hydrolase protein  26.89 
 
 		 279 aa  52.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 271 aa  52.8  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 		 259 aa  52.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  42.72 
 
 		 264 aa  52.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3821  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 256 aa  52.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3302  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 		 275 aa  52.4  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0651749  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  26.02 
 
 		 282 aa  52.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  23.37 
 
 		 264 aa  52.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3228  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 		 281 aa  52.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  37.74 
 
 		 332 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 		 267 aa  52.4  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 		 275 aa  52  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  27.2 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  28.96 
 
 		 258 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1071  alpha/beta hydrolase fold protein  35.61 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  29.91 
 
 		 284 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  41.35 
 
 		 275 aa  51.6  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1731  alpha/beta hydrolase fold  36.11 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8768  putative hydrolase  32.71 
 
 		 272 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  28.52 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  43.02 
 
 		 350 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2519  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  38.68 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0304  Alpha/beta hydrolase  23.46 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6057  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 		 332 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00402067  normal  0.493992 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0178  alpha/beta fold family hydrolase  33.64 
 
 		 296 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 322 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  35.2 
 
 		 284 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  35.45 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  41.77 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  36.19 
 
 		 273 aa  50.4  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 		 296 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  33.05 
 
 		 277 aa  50.4  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2073  alpha/beta hydrolase fold  29.47 
 
 		 278 aa  50.1  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.944371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24610  putative hydrolytic enzyme  37.74 
 
 		 333 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3478  alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 		 295 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3803  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 252 aa  50.1  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 308 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3081  alpha/beta hydrolase fold protein  42.11 
 
 		 371 aa  50.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0542902  normal  0.696639 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1091  alpha/beta hydrolase fold protein  33.63 
 
 		 367 aa  50.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0905428  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0653  alpha/beta hydrolase fold protein  34.91 
 
 		 310 aa  50.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.754721  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  29.84 
 
 		 279 aa  49.7  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  27.2 
 
 		 275 aa  49.7  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  36.67 
 
 		 292 aa  49.7  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2639  alpha/beta hydrolase fold  36.45 
 
 		 280 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2684  alpha/beta hydrolase fold  36.45 
 
 		 280 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.9064  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2668  alpha/beta hydrolase fold  36.45 
 
 		 280 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1609  Alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 293 aa  49.3  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1228  alpha/beta hydrolase fold protein  23.79 
 
 		 265 aa  49.3  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2147  Alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 		 350 aa  48.9  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.365847 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  32.74 
 
 		 286 aa  49.3  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1579  alpha/beta fold family hydrolase  20.75 
 
 		 265 aa  48.9  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  45.33 
 
 		 361 aa  48.9  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14030  prolyl aminopeptidase  31.58 
 
 		 257 aa  48.9  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.980641  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  25.79 
 
 		 380 aa  48.9  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6598  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 		 283 aa  48.9  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2939  Alpha/beta hydrolase  34.74 
 
 		 345 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  27.47 
 
 		 294 aa  48.9  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  39.81 
 
 		 266 aa  48.9  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  25.78 
 
 		 301 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>