More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3365 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3365  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 265 aa  522  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.6363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3606  alpha/beta hydrolase fold  89.81 
 
 		 265 aa  474  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  61.09 
 
 		 259 aa  324  7e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3293  alpha/beta hydrolase fold  59 
 
 		 323 aa  293  2e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104393  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3177  Alpha/beta hydrolase fold-1  57.09 
 
 		 272 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.97494  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3368  alpha/beta hydrolase fold protein  56.32 
 
 		 326 aa  265  7e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  50.76 
 
 		 263 aa  259  4e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5863  alpha/beta hydrolase fold protein  51.14 
 
 		 265 aa  256  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.279453 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4208  alpha/beta hydrolase fold protein  55.28 
 
 		 268 aa  248  8e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1509  alpha/beta hydrolase fold  48.76 
 
 		 261 aa  224  8e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.725835  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1106  alpha/beta hydrolase fold protein  45.7 
 
 		 283 aa  224  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.112481  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1470  alpha/beta hydrolase fold protein  45.24 
 
 		 315 aa  214  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1367  alpha/beta hydrolase fold  45.24 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  39.77 
 
 		 279 aa  186  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0653  alpha/beta hydrolase fold protein  36.89 
 
 		 310 aa  176  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.754721  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1790  alpha/beta hydrolase fold  39.13 
 
 		 287 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.333084  hitchhiker  0.00365614 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2025  alpha/beta hydrolase fold protein  40.46 
 
 		 276 aa  163  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  42.06 
 
 		 284 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0017  alpha/beta hydrolase fold  33.84 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0512561 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  42.91 
 
 		 284 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  42.51 
 
 		 284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2639  alpha/beta hydrolase fold  36.92 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2684  alpha/beta hydrolase fold  36.92 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.9064  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2668  alpha/beta hydrolase fold  36.54 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0737  alpha/beta hydrolase fold protein  33.46 
 
 		 273 aa  139  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.755425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  34.07 
 
 		 287 aa  135  9e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  33.61 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.466438 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4536  alpha/beta hydrolase fold protein  35.09 
 
 		 279 aa  132  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.0123379 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  36.25 
 
 		 273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5414  alpha/beta hydrolase fold protein  34.17 
 
 		 261 aa  126  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  36.47 
 
 		 282 aa  122  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  36.92 
 
 		 258 aa  118  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1299  hypothetical protein  30.67 
 
 		 262 aa  118  9e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000570356  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  25.29 
 
 		 286 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  30.92 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3585  alpha/beta hydrolase fold  35.63 
 
 		 270 aa  106  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  29.66 
 
 		 279 aa  105  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  24.6 
 
 		 283 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  44.96 
 
 		 425 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3027  alpha/beta hydrolase fold protein  29.82 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1287  alpha/beta hydrolase fold protein  43.65 
 
 		 255 aa  94.4  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00130508  normal  0.0205637 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2090  putative hydrolase  30.62 
 
 		 233 aa  91.7  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  30.62 
 
 		 233 aa  90.9  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 		 271 aa  90.1  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 272 aa  89  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  39.83 
 
 		 265 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  42.86 
 
 		 258 aa  85.9  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2555  alpha/beta hydrolase fold protein  27.89 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.249679  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  28.29 
 
 		 281 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  46.09 
 
 		 270 aa  82  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  28.41 
 
 		 263 aa  82  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  40.68 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 		 280 aa  81.6  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3797  alpha/beta hydrolase fold protein  33.87 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  25.73 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  25.95 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0186  alpha/beta hydrolase fold protein  44.44 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  37.29 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  37.29 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  37.29 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  34.75 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  40.83 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  39.5 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  33.05 
 
 		 262 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  30.32 
 
 		 267 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  41.74 
 
 		 269 aa  75.5  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  34.75 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  24.31 
 
 		 562 aa  75.1  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  31.4 
 
 		 264 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  26.54 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2054  alpha/beta hydrolase fold  29.68 
 
 		 252 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0866141  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1534  lipolytic enzyme  33.87 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.277395  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  32.73 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  31 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1808  hypothetical protein  26.47 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  37.6 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  33.9 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  30.58 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  24.01 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0099  alpha/beta fold family hydrolase  26.89 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000675213 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  35.29 
 
 		 265 aa  72  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  36.07 
 
 		 277 aa  72  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  32.52 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1067  alpha/beta hydrolase fold protein  28.29 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0777  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.547366 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  37.29 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0125  hydrolase  23.7 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.577709  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  37.33 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  22.27 
 
 		 571 aa  70.5  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>