More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1228 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1228  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
265 aa  543  1e-154  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2533  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
394 aa  89.7  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  hitchhiker  0.000713201 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1813  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 
287 aa  85.5  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.557453  normal  0.0116174 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  25.2 
 
 
283 aa  79.3  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8363  hypothetical protein  28.57 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  26.23 
 
 
286 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  26.24 
 
 
277 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0369  alpha/beta hydrolase fold protein  37.27 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.598497 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  37.27 
 
 
259 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  27.02 
 
 
258 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.8 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  24.15 
 
 
270 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 
268 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
267 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3917  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 
251 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  38.83 
 
 
270 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  22.65 
 
 
279 aa  67  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  35.19 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  26.79 
 
 
265 aa  66.2  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  28.33 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  28.33 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  36.13 
 
 
288 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1447  alpha/beta hydrolase fold protein  31.4 
 
 
271 aa  65.5  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  28.33 
 
 
256 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 
257 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  31.85 
 
 
275 aa  64.7  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  26.12 
 
 
304 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  41.24 
 
 
270 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  38.74 
 
 
266 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  26.05 
 
 
270 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 
277 aa  63.5  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1592  alpha/beta hydrolase fold  36.11 
 
 
267 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121533  normal  0.0764642 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3723  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 
281 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0906881  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  36.54 
 
 
226 aa  63.2  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2519  alpha/beta hydrolase fold  37.38 
 
 
243 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.54258 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5612  alpha/beta hydrolase fold  28.23 
 
 
311 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00676484  hitchhiker  0.00203627 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  24.05 
 
 
270 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  31.65 
 
 
275 aa  62.4  0.000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2933  alpha/beta hydrolase fold protein  26.29 
 
 
260 aa  62  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  hitchhiker  0.000486055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  34.91 
 
 
297 aa  62  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4536  alpha/beta hydrolase fold protein  31.78 
 
 
279 aa  62  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.0123379 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01577  hypothetical protein  26.54 
 
 
267 aa  61.6  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  36.27 
 
 
233 aa  61.6  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  31.45 
 
 
290 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  27.46 
 
 
264 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.754545  normal  0.278795 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 
271 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2695  alpha/beta hydrolase fold protein  25.83 
 
 
258 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0224945 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  37.74 
 
 
293 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  23.91 
 
 
259 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1055  alpha/beta hydrolase  30.91 
 
 
239 aa  60.8  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  23.01 
 
 
280 aa  61.2  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  25.21 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3797  alpha/beta hydrolase fold protein  28.17 
 
 
248 aa  61.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  33.65 
 
 
303 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2233  3-oxoadipate enol-lactonase  25.49 
 
 
300 aa  61.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  36.89 
 
 
276 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139412 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  28.99 
 
 
253 aa  60.5  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 
289 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  41.3 
 
 
272 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  25.5 
 
 
275 aa  60.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  23.27 
 
 
279 aa  60.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  22.01 
 
 
287 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  22.5 
 
 
270 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.71 
 
 
265 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5402  3-oxoadipate enol-lactonase  27.75 
 
 
255 aa  60.1  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2090  putative hydrolase  35.29 
 
 
233 aa  60.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 
278 aa  60.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  39.25 
 
 
229 aa  60.1  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  36.04 
 
 
309 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  39.58 
 
 
281 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1825  alpha/beta hydrolase fold  36.54 
 
 
243 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388616  normal  0.284005 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0115  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  36.29 
 
 
236 aa  59.7  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  34.04 
 
 
284 aa  59.7  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.466438 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1931  alpha/beta hydrolase fold protein  26.04 
 
 
258 aa  59.3  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0079  alpha/beta hydrolase superfamily protein  36.19 
 
 
291 aa  58.9  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1091  alpha/beta hydrolase fold protein  38.53 
 
 
367 aa  59.3  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0905428  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  26.18 
 
 
264 aa  58.9  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  32.74 
 
 
277 aa  58.9  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0737  alpha/beta hydrolase fold protein  30.56 
 
 
273 aa  58.9  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.755425  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6949  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
254 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0162  3-oxoadipate enol-lactonase  26.16 
 
 
261 aa  58.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  25.98 
 
 
299 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.43 
 
 
372 aa  58.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  37.89 
 
 
271 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  31.87 
 
 
250 aa  58.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  36.11 
 
 
292 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0565  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 
270 aa  58.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.441314  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1567  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 
261 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.151157 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3588  alpha/beta hydrolase fold protein  25.28 
 
 
282 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 
275 aa  58.5  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0318  alpha/beta hydrolase fold  23.6 
 
 
308 aa  57.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  24.38 
 
 
277 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  35.59 
 
 
263 aa  57.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  37.25 
 
 
291 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  24.33 
 
 
286 aa  57.4  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>