More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0318 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0318  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
308 aa  627  1e-179  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  29.48 
 
 
273 aa  94.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
291 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
291 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
291 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  32.91 
 
 
283 aa  87  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  31.28 
 
 
275 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  28.11 
 
 
276 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  28.51 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.84 
 
 
368 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.85 
 
 
368 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.33 
 
 
368 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  32.08 
 
 
283 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 
283 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 
278 aa  79  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  29.37 
 
 
304 aa  79  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 
276 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  24.73 
 
 
271 aa  78.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 
295 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3771  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 
282 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3844  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 
282 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  24.74 
 
 
309 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 
290 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  24.14 
 
 
323 aa  74.3  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  26.49 
 
 
315 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  26.49 
 
 
315 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 
312 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  32.52 
 
 
278 aa  73.6  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  27.61 
 
 
296 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  28.31 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 
280 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  31.93 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  32.85 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  39.17 
 
 
340 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  39.17 
 
 
340 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3783  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
280 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.106852  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  39.17 
 
 
340 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 
267 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  27.47 
 
 
279 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 
312 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  27.54 
 
 
273 aa  72  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
286 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  25.82 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 
314 aa  72  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  31.39 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 
274 aa  71.2  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  26.05 
 
 
288 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  23.28 
 
 
253 aa  71.2  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 
278 aa  70.9  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  26.15 
 
 
299 aa  70.5  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  26.1 
 
 
308 aa  70.1  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  26.71 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  25.08 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  26.1 
 
 
290 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 
340 aa  68.9  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  24.73 
 
 
309 aa  68.9  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  26.33 
 
 
340 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3884  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 
286 aa  68.6  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.330831  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  36.67 
 
 
341 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  26.24 
 
 
372 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  25.94 
 
 
282 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.61 
 
 
370 aa  68.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  28.96 
 
 
289 aa  68.9  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  26.49 
 
 
275 aa  68.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2485  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
353 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.125677 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4238  alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 
274 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.919736  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  26.24 
 
 
328 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  36.76 
 
 
298 aa  67.8  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2154  alpha/beta hydrolase fold protein  36.97 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016859 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  27.71 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1302  alpha/beta hydrolase fold  26.06 
 
 
285 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12311  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  26.52 
 
 
346 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.46 
 
 
372 aa  67.4  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  25.67 
 
 
246 aa  67  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 
285 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.47 
 
 
370 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 
285 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  23.72 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  26.24 
 
 
273 aa  67  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  26.24 
 
 
273 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 
302 aa  66.6  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  36.67 
 
 
340 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2364  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 
352 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  33.05 
 
 
265 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  22.58 
 
 
284 aa  66.2  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 
304 aa  66.2  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  35.94 
 
 
340 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 
302 aa  65.9  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  24.54 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  25.89 
 
 
328 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5690  Alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 
283 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  27.05 
 
 
333 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0068  alpha/beta hydrolase fold  24.8 
 
 
297 aa  65.5  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5633  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 
274 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  25.66 
 
 
254 aa  65.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.659236 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>