More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2485 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2485  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 353 aa  703    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125677 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2364  alpha/beta hydrolase fold  83.57 
 
 		 352 aa  582  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2766  alpha/beta hydrolase fold protein  42.65 
 
 		 277 aa  179  7e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0276  alpha/beta hydrolase fold protein  38.04 
 
 		 325 aa  169  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267847  normal  0.743804 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3207  alpha/beta hydrolase fold protein  37.28 
 
 		 294 aa  161  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.711574 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 405 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  27.5 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  34.04 
 
 		 272 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  30.47 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  29.47 
 
 		 284 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  28.88 
 
 		 282 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  29.54 
 
 		 282 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  25.71 
 
 		 278 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  23.57 
 
 		 284 aa  92.8  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3602  Alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 306 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.183144 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  30.19 
 
 		 275 aa  90.9  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  27.59 
 
 		 298 aa  90.5  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  30.6 
 
 		 308 aa  90.1  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  24.3 
 
 		 273 aa  89.7  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  29.35 
 
 		 309 aa  89.4  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2527  esterase-like  30.6 
 
 		 280 aa  87.8  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  27.76 
 
 		 315 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 		 339 aa  87.8  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  27.76 
 
 		 315 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 		 295 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 		 240 aa  85.5  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2925  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  27.84 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  26.37 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  28.12 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0604  alpha/beta hydrolase fold  24.65 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.791043 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  26.3 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  29.19 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4087  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase  43.8 
 
 		 556 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.779957  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1799  Alpha/beta hydrolase fold  41.96 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  30.39 
 
 		 272 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.88 
 
 		 367 aa  81.6  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  27.85 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1764  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 256 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  28.1 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  27.78 
 
 		 453 aa  79.7  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  26.79 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3372  alpha/beta hydrolase fold protein  30.31 
 
 		 287 aa  79.3  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000420005  normal  0.0275463 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  37.07 
 
 		 562 aa  79.3  0.00000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1465  alpha/beta hydrolase fold protein  30.07 
 
 		 289 aa  79  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.647363  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  27.65 
 
 		 285 aa  79  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 		 284 aa  79  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  28.12 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4294  alpha/beta hydrolase fold protein  27.86 
 
 		 286 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  26.91 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  40 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  26.37 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  25.4 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  28.66 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  27.46 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  38.32 
 
 		 571 aa  77.4  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  26.52 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  29.79 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  26.03 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  26.76 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  28.88 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3130  alpha/beta hydrolase fold protein  28.31 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  27.01 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  25.77 
 
 		 288 aa  75.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  23.86 
 
 		 278 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  27.7 
 
 		 284 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  40.46 
 
 		 311 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  26.96 
 
 		 275 aa  75.9  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 		 290 aa  75.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3642  alpha/beta fold family hydrolase  24.19 
 
 		 262 aa  75.5  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  24.07 
 
 		 314 aa  75.9  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  27.57 
 
 		 328 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  25.5 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  28.1 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  28.18 
 
 		 350 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0302  carboxymuconolactone decarboxylase  30.29 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0830882  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  27.87 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  24.48 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1445  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  24.48 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0463  alpha/beta hydrolase fold protein  28.97 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  24.48 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4115  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.52 
 
 		 443 aa  73.9  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5145  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>