More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0737 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0737  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
273 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.755425  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0653  alpha/beta hydrolase fold protein  35.38 
 
 
310 aa  201  9e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.754721  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  38.28 
 
 
279 aa  198  7.999999999999999e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3177  Alpha/beta hydrolase fold-1  38.26 
 
 
272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.97494  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1790  alpha/beta hydrolase fold  37.45 
 
 
287 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.333084  hitchhiker  0.00365614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  37.69 
 
 
259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3293  alpha/beta hydrolase fold  36.6 
 
 
323 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104393  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1367  alpha/beta hydrolase fold  38.13 
 
 
310 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2025  alpha/beta hydrolase fold protein  35.6 
 
 
276 aa  159  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1106  alpha/beta hydrolase fold protein  37.97 
 
 
283 aa  158  9e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.112481  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1470  alpha/beta hydrolase fold protein  38.02 
 
 
315 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0017  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 
327 aa  154  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0512561 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3368  alpha/beta hydrolase fold protein  35.09 
 
 
326 aa  151  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  36.88 
 
 
284 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  37.09 
 
 
273 aa  150  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  37.7 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  35.74 
 
 
284 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1509  alpha/beta hydrolase fold  36.82 
 
 
261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.725835  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  34.21 
 
 
287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3606  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 
265 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  34.98 
 
 
284 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5414  alpha/beta hydrolase fold protein  33.9 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3365  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 
265 aa  139  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.6363  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4208  alpha/beta hydrolase fold protein  35.5 
 
 
268 aa  139  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2639  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 
280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2684  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 
280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.9064  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2668  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 
280 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105125  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  33.21 
 
 
284 aa  130  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.466438 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4536  alpha/beta hydrolase fold protein  33.98 
 
 
279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.0123379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5863  alpha/beta hydrolase fold protein  32.71 
 
 
265 aa  125  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.279453 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1299  hypothetical protein  31.8 
 
 
262 aa  119  7e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000570356  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3027  alpha/beta hydrolase fold protein  29.8 
 
 
285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  32.13 
 
 
286 aa  112  5e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 
279 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 
283 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3585  alpha/beta hydrolase fold  33.8 
 
 
270 aa  99  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  28.09 
 
 
279 aa  97.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  26.39 
 
 
283 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1534  lipolytic enzyme  26.54 
 
 
294 aa  94.4  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.277395  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  27.86 
 
 
425 aa  91.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  35.66 
 
 
305 aa  90.9  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 
267 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
278 aa  88.2  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  26.74 
 
 
296 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2090  putative hydrolase  29.03 
 
 
233 aa  87  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  27.1 
 
 
282 aa  86.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
272 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  26.94 
 
 
276 aa  85.9  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  27.73 
 
 
258 aa  85.9  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  28.57 
 
 
233 aa  85.5  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  28.1 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  24.09 
 
 
265 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  26.36 
 
 
296 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 
270 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 
271 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  25.28 
 
 
296 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
280 aa  83.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0125  hydrolase  39.81 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.577709  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  25.47 
 
 
281 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3289  alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 
250 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.931458  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  25.97 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2191  hydrolase  39.81 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000799459  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  25.87 
 
 
270 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  32.52 
 
 
290 aa  82  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  28.77 
 
 
277 aa  81.6  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  24.44 
 
 
270 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1714  alpha/beta hydrolase fold  39.05 
 
 
265 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  23.05 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  30.28 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 
291 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 
291 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 
291 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2134  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 
250 aa  79  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.470034  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0910  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 
253 aa  79  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.592226 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  35.9 
 
 
273 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  29.6 
 
 
372 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 
271 aa  77.4  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  39 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  23.66 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  35.9 
 
 
273 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  23.66 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5234  putative hydrolase  32.98 
 
 
249 aa  77  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373086  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  32.35 
 
 
271 aa  77  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  35.9 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  41.18 
 
 
270 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  35.9 
 
 
328 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3917  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 
251 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 
276 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
294 aa  76.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  24.7 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0886  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 
250 aa  76.3  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  24.63 
 
 
309 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 
278 aa  76.3  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  26.49 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  36.44 
 
 
270 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  26.03 
 
 
284 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4262  esterase/lipase/thioesterase  42.34 
 
 
262 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4136  alpha/beta hydrolase fold  42.34 
 
 
262 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>