More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2025 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2025  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
276 aa  556  1e-157  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3177  Alpha/beta hydrolase fold-1  49.6 
 
 
272 aa  208  6e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.97494  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3293  alpha/beta hydrolase fold  47.01 
 
 
323 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104393  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3368  alpha/beta hydrolase fold protein  45.93 
 
 
326 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0653  alpha/beta hydrolase fold protein  37.26 
 
 
310 aa  191  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.754721  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  37.69 
 
 
279 aa  187  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  42.21 
 
 
287 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  40.96 
 
 
273 aa  177  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  40.82 
 
 
284 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1790  alpha/beta hydrolase fold  35.94 
 
 
287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.333084  hitchhiker  0.00365614 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5414  alpha/beta hydrolase fold protein  40.68 
 
 
261 aa  172  6.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  41.29 
 
 
284 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  40.91 
 
 
284 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4208  alpha/beta hydrolase fold protein  42.8 
 
 
268 aa  168  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  40.23 
 
 
259 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3365  alpha/beta hydrolase fold  40.46 
 
 
265 aa  163  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.6363  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1509  alpha/beta hydrolase fold  41.98 
 
 
261 aa  161  9e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.725835  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0737  alpha/beta hydrolase fold protein  36.29 
 
 
273 aa  159  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.755425  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1106  alpha/beta hydrolase fold protein  37.96 
 
 
283 aa  158  8e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.112481  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0017  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 
327 aa  156  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0512561 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  39.16 
 
 
263 aa  152  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2639  alpha/beta hydrolase fold  36.53 
 
 
280 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2684  alpha/beta hydrolase fold  36.53 
 
 
280 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.9064  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5863  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 
265 aa  152  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.279453 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3606  alpha/beta hydrolase fold  39.31 
 
 
265 aa  150  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2668  alpha/beta hydrolase fold  36.16 
 
 
280 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105125  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4536  alpha/beta hydrolase fold protein  38.49 
 
 
279 aa  149  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.0123379 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  37.02 
 
 
284 aa  148  7e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.466438 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1299  hypothetical protein  32.77 
 
 
262 aa  140  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000570356  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3585  alpha/beta hydrolase fold  37.82 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 
279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1367  alpha/beta hydrolase fold  35.74 
 
 
310 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1470  alpha/beta hydrolase fold protein  34.98 
 
 
315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  27.31 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  31.73 
 
 
279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  26.8 
 
 
283 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  26.4 
 
 
283 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  31.13 
 
 
282 aa  96.7  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3027  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 
285 aa  94.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  31.5 
 
 
258 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 
272 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 
425 aa  90.5  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
280 aa  88.6  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  28.41 
 
 
281 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1287  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 
255 aa  87  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00130508  normal  0.0205637 
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  28.71 
 
 
233 aa  86.7  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2090  putative hydrolase  28.23 
 
 
233 aa  85.5  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  25.7 
 
 
275 aa  84.7  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  26.21 
 
 
276 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  26.61 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
267 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1534  lipolytic enzyme  26.27 
 
 
294 aa  82.4  0.000000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.277395  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 
271 aa  81.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  28.8 
 
 
226 aa  81.3  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  33.5 
 
 
250 aa  79  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0821  esterase/lipase/thioesterase  28.09 
 
 
256 aa  77  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2479  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 
256 aa  77  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.261597 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2612  alpha/beta hydrolase fold  38.94 
 
 
250 aa  76.3  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  0.0292589 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  28.2 
 
 
277 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  26.22 
 
 
268 aa  75.5  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  26.42 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  27.42 
 
 
270 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  26.49 
 
 
265 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
275 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  27.09 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  27.09 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  24.66 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  25.53 
 
 
373 aa  73.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0918  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.891406  normal  0.241554 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 
280 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2134  alpha/beta hydrolase fold  32.47 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.470034  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  26.17 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  26.17 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0445  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 
257 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  27.24 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 
269 aa  72  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  27.34 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  26.17 
 
 
256 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
271 aa  72  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  26.61 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  41.73 
 
 
368 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3040  3-oxoadipate enol-lactonase  26.64 
 
 
253 aa  71.2  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  41.73 
 
 
368 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  42.74 
 
 
368 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  26.56 
 
 
282 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  28.27 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  27.8 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6102  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  26.52 
 
 
277 aa  70.5  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  28.96 
 
 
282 aa  70.1  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  24.81 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  25.9 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  27.6 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  25.19 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>