More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0653 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0653  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 310 aa  641    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.754721  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  46.33 
 
 		 279 aa  248  6e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3293  alpha/beta hydrolase fold  39.12 
 
 		 323 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104393  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1790  alpha/beta hydrolase fold  42.57 
 
 		 287 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.333084  hitchhiker  0.00365614 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3177  Alpha/beta hydrolase fold-1  41.9 
 
 		 272 aa  218  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.97494  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3368  alpha/beta hydrolase fold protein  38.78 
 
 		 326 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0017  alpha/beta hydrolase fold  38.6 
 
 		 327 aa  208  7e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0512561 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2639  alpha/beta hydrolase fold  39.93 
 
 		 280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2684  alpha/beta hydrolase fold  39.93 
 
 		 280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.9064  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2668  alpha/beta hydrolase fold  39.56 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0737  alpha/beta hydrolase fold protein  35.16 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.755425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2025  alpha/beta hydrolase fold protein  37.26 
 
 		 276 aa  191  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  40.54 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  39.21 
 
 		 287 aa  186  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  39.62 
 
 		 284 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1509  alpha/beta hydrolase fold  37.31 
 
 		 261 aa  179  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.725835  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  39.62 
 
 		 284 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3365  alpha/beta hydrolase fold  36.89 
 
 		 265 aa  176  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.6363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  38.87 
 
 		 263 aa  176  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3606  alpha/beta hydrolase fold  37.3 
 
 		 265 aa  176  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1106  alpha/beta hydrolase fold protein  37.2 
 
 		 283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.112481  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  38.49 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4208  alpha/beta hydrolase fold protein  40.08 
 
 		 268 aa  168  9e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  37.01 
 
 		 273 aa  166  5e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1470  alpha/beta hydrolase fold protein  36.78 
 
 		 315 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1367  alpha/beta hydrolase fold  36.82 
 
 		 310 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  36.7 
 
 		 284 aa  155  8e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.466438 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1299  hypothetical protein  34.35 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000570356  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5863  alpha/beta hydrolase fold protein  34.14 
 
 		 265 aa  149  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.279453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4536  alpha/beta hydrolase fold protein  35.69 
 
 		 279 aa  145  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.0123379 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5414  alpha/beta hydrolase fold protein  35.42 
 
 		 261 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  29.69 
 
 		 286 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  30 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  30.61 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  32.3 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  29.66 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  29.32 
 
 		 279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3585  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 		 279 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 		 272 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1534  lipolytic enzyme  25.33 
 
 		 294 aa  102  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.277395  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  26.83 
 
 		 267 aa  99.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 425 aa  99.4  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  28.72 
 
 		 281 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3027  alpha/beta hydrolase fold protein  27.15 
 
 		 285 aa  97.1  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  27.54 
 
 		 276 aa  96.3  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 		 280 aa  92.8  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  40 
 
 		 233 aa  92.8  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2090  putative hydrolase  40 
 
 		 233 aa  92.4  8e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3907  alpha/beta hydrolase fold  27.63 
 
 		 269 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804884  normal  0.943348 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  26.57 
 
 		 270 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4021  alpha/beta hydrolase fold protein  27.63 
 
 		 269 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.000000197083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 		 270 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 		 270 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 		 270 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 		 270 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  26.77 
 
 		 270 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  35.9 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  35.04 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  38.79 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2612  alpha/beta hydrolase fold  39.83 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  0.0292589 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  40.35 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  36.11 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  35.34 
 
 		 264 aa  79  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  36.97 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  29.52 
 
 		 263 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6102  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0099  alpha/beta fold family hydrolase  25.4 
 
 		 220 aa  78.2  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000675213 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  25.47 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  32.33 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  35.34 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  34.48 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  24.29 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  32.82 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0908  alpha/beta hydrolase fold protein  32.23 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000766289  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  24.35 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  36.75 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  35.78 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  31.61 
 
 		 286 aa  75.5  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.73231  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  38.28 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2134  alpha/beta hydrolase fold  38.26 
 
 		 250 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.470034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  23.36 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 264 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  35.78 
 
 		 277 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0502  alpha/beta hydrolase fold  22.85 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  37.61 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  23.74 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2555  alpha/beta hydrolase fold protein  29.26 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.249679  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1714  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  23.74 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  35.9 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  34.13 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>