More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0910 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0910  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 253 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.592226 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0886  alpha/beta hydrolase fold  98.8 
 
 		 250 aa  506  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  29.63 
 
 		 267 aa  95.5  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  32.56 
 
 		 259 aa  83.2  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0737  alpha/beta hydrolase fold protein  28.14 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.755425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  29.27 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1825  alpha/beta hydrolase fold  32.98 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388616  normal  0.284005 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2519  alpha/beta hydrolase fold  26.8 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54258 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  28.06 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  29.24 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  26.81 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14030  prolyl aminopeptidase  25.2 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.980641  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3027  alpha/beta hydrolase fold protein  27.95 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  29.52 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  39.1 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1790  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.333084  hitchhiker  0.00365614 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  34.78 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.45 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  34.71 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  25.28 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  38.46 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  33.9 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0803  alpha/beta hydrolase fold  41 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  33.05 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  27.93 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0369  alpha/beta hydrolase fold protein  26.94 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.598497 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1911  alpha/beta hydrolase fold protein  41.75 
 
 		 354 aa  69.7  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00103151  hitchhiker  0.0000592748 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2090  putative hydrolase  37.61 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  37.74 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_004310  BR1264  alpha/beta fold family hydrolase  38.17 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669274  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  30.65 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  40.71 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  28.25 
 
 		 277 aa  68.9  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  34.45 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2745  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  22.64 
 
 		 252 aa  68.6  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000661115  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  33.61 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 		 291 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0769  alpha/beta fold family hydrolase  26.67 
 
 		 259 aa  68.6  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.290033  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 		 291 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 		 291 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2128  alpha/beta hydrolase fold protein  39.81 
 
 		 356 aa  68.6  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0653  alpha/beta hydrolase fold  35.51 
 
 		 262 aa  68.6  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.748775  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0638  alpha/beta hydrolase fold  35.51 
 
 		 262 aa  68.6  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  27.87 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  33.05 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.73231  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0585  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  25.19 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  27.63 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1226  alpha/beta fold family hydrolase  37.4 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  24.03 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  28.86 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  30.54 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  23.02 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  28.05 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1731  alpha/beta hydrolase fold  39.67 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  25.27 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  25.19 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2545  hydrolase  35.75 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5097  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  27.23 
 
 		 308 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  36.52 
 
 		 332 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 		 280 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  40.19 
 
 		 308 aa  67  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  24.55 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  36.52 
 
 		 332 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0777  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.547366 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0377  alpha/beta hydrolase fold  32.67 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.303616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1972  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  34.51 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  24.44 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  23.19 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  35.65 
 
 		 332 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4035  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 280 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.688921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3993  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 280 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  32.5 
 
 		 321 aa  65.5  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 		 354 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  37.07 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  27.39 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  30.67 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  34.21 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  38.98 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1449  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1467  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  26.58 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  30.37 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  31.03 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  32.48 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>