More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1911 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1911  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 354 aa  719    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00103151  hitchhiker  0.0000592748 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2128  alpha/beta hydrolase fold protein  82.2 
 
 		 356 aa  613  9.999999999999999e-175  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0368  alpha/beta hydrolase fold protein  66.1 
 
 		 355 aa  466  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.324688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3801  alpha/beta hydrolase fold  46.57 
 
 		 351 aa  327  1.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  49.14 
 
 		 361 aa  313  1.9999999999999998e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0803  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 		 353 aa  308  1.0000000000000001e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2389  alpha/beta hydrolase fold protein  46.4 
 
 		 351 aa  295  8e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000065043  decreased coverage  0.000121837 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1091  alpha/beta hydrolase fold protein  45.07 
 
 		 367 aa  281  1e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0905428  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8516  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  44.9 
 
 		 337 aa  265  8.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal  0.759464 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  32.43 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0369  alpha/beta hydrolase fold protein  31.94 
 
 		 262 aa  75.5  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.598497 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  31.35 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  34.4 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  34.75 
 
 		 270 aa  72  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  34.96 
 
 		 288 aa  72  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  40.43 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  34.12 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0886  alpha/beta hydrolase fold  41.75 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0910  alpha/beta hydrolase fold  41.75 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.592226 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  29.95 
 
 		 272 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  38.58 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0146  alpha/beta hydrolase fold protein  35.04 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  35.37 
 
 		 276 aa  67  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 287 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3835  Alpha/beta hydrolase fold  32.81 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0435059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  31.11 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  34.93 
 
 		 263 aa  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  31.11 
 
 		 304 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  31.11 
 
 		 304 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  34.13 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.66 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2043  alpha/beta hydrolase fold  34.96 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  38.39 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  32.09 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1837  Alpha/beta hydrolase fold  35.59 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  33.96 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  36.13 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3383  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  31.34 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3040  alpha/beta fold family hydrolase  31.06 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  32 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  32.72 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  30.6 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  38 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  34.23 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 287 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  32.77 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  33.96 
 
 		 275 aa  62.4  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  39.13 
 
 		 323 aa  62.4  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9504  alpha/beta hydrolase protein  26.32 
 
 		 272 aa  62.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.932687  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  30.97 
 
 		 359 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  37 
 
 		 322 aa  62  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  31.37 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2671  haloalkane dehalogenase  33.33 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.731283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3020  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5346  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00669533  normal  0.437988 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  34.71 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6199  alpha/beta hydrolase fold protein  32.37 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.82135  normal  0.298395 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4924  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  32.11 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  32.06 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  36.8 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.23 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  32.08 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  32.48 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  33.63 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  34.23 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7519  alpha/beta hydrolase fold protein  30.99 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  33.64 
 
 		 2762 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3736  alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  31.33 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5225  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5124  alpha/beta hydrolase fold protein  35.43 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  30.23 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4694  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  30.67 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0304  Alpha/beta hydrolase  25.9 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2992  Haloacetate dehalogenase H-1  32.99 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.779666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4202  epoxide hydrolase  28.23 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  33.88 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  33.62 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0705  alpha/beta hydrolase fold  39.42 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  35.54 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  32.23 
 
 		 562 aa  59.7  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  32.54 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  30.22 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  25.62 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  30.51 
 
 		 294 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 278 aa  58.9  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>