More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3020 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_3020  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 283 aa  584  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5346  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 283 aa  584  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00669533  normal  0.437988 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4924  alpha/beta hydrolase fold  98.23 
 
 		 283 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0304  Alpha/beta hydrolase  96.82 
 
 		 283 aa  570  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4694  alpha/beta hydrolase fold  96.47 
 
 		 283 aa  547  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3383  alpha/beta hydrolase fold  93.66 
 
 		 284 aa  543  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5225  alpha/beta hydrolase fold  96.11 
 
 		 283 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6598  alpha/beta hydrolase fold protein  69.4 
 
 		 283 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0682  alpha/beta family hydrolase  67.97 
 
 		 286 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4356  alpha/beta hydrolase fold  68.33 
 
 		 283 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1609  Alpha/beta hydrolase fold  63.76 
 
 		 293 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1132  putative hydrolase  58.65 
 
 		 285 aa  328  9e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5527  alpha/beta hydrolase fold  58.43 
 
 		 307 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.563792  normal  0.509486 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5203  alpha/beta hydrolase fold protein  58.2 
 
 		 260 aa  316  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112668  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28630  putative hydrolase  44.15 
 
 		 287 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000201744 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2502  putative hydrolase  44.15 
 
 		 283 aa  192  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1813  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 287 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.557453  normal  0.0116174 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2533  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 		 394 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  hitchhiker  0.000713201 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1592  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121533  normal  0.0764642 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 		 277 aa  97.4  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03123  hydrolase protein  28.31 
 
 		 279 aa  95.9  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  23.97 
 
 		 277 aa  82.4  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0186  alpha/beta hydrolase fold protein  27.55 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  28.96 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2945  alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.238938 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  28.78 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 314 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  27.94 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  24.55 
 
 		 267 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  25.98 
 
 		 269 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  36.94 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6084  hydrolase  27.03 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3803  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  35.4 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  27.92 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  26.33 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  33.06 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  33.58 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4279  alpha/beta hydrolase fold  25.54 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52768  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2333  alpha/beta fold family hydrolase  25.18 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  25.94 
 
 		 328 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  32.82 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  26.03 
 
 		 372 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  24.2 
 
 		 300 aa  68.9  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  24.26 
 
 		 258 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2128  alpha/beta hydrolase fold protein  30.5 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  28.4 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.754545  normal  0.278795 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1192  alpha/beta superfamily hydrolase  31.09 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  27.65 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  27.65 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  38.26 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  25.09 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  23.81 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  36 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0351  alpha/beta hydrolase fold  36.59 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.347807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  27.44 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.94 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  25.6 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  33.05 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  23.31 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0369  alpha/beta hydrolase fold protein  26.29 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.598497 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0368  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 355 aa  65.9  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.324688 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  31.45 
 
 		 562 aa  65.9  0.0000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2240  alpha/beta hydrolase fold protein  24.81 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000309374  hitchhiker  0.000000000781643 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3352  alpha/beta superfamily hydrolase  26.1 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0154019  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  23.81 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  26.78 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  37.9 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  25.76 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  22.06 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  32.06 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2527  alpha/beta hydrolase fold protein  32.84 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104657  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  31.25 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  25.63 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1920  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  unclonable  0.00000223856 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  25.62 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  25.93 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  24.72 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2033  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000295645  hitchhiker  0.000143979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8516  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  35.24 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal  0.759464 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1880  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000336147  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05110  expressed protein  35.9 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  21.38 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5136  alpha/beta hydrolase fold protein  22.95 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>