More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5225 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5225  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 283 aa  584  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4694  alpha/beta hydrolase fold  98.94 
 
 		 283 aa  580  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0304  Alpha/beta hydrolase  97.53 
 
 		 283 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3020  alpha/beta hydrolase fold  96.11 
 
 		 283 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4924  alpha/beta hydrolase fold  95.41 
 
 		 283 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5346  alpha/beta hydrolase fold  96.11 
 
 		 283 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00669533  normal  0.437988 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3383  alpha/beta hydrolase fold  92.61 
 
 		 284 aa  541  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6598  alpha/beta hydrolase fold protein  70.11 
 
 		 283 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0682  alpha/beta family hydrolase  67.62 
 
 		 286 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4356  alpha/beta hydrolase fold  67.97 
 
 		 283 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1609  Alpha/beta hydrolase fold  64.46 
 
 		 293 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1132  putative hydrolase  58.65 
 
 		 285 aa  330  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5527  alpha/beta hydrolase fold  57.68 
 
 		 307 aa  326  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.563792  normal  0.509486 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5203  alpha/beta hydrolase fold protein  58.59 
 
 		 260 aa  319  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112668  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2502  putative hydrolase  44.15 
 
 		 283 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28630  putative hydrolase  44.53 
 
 		 287 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000201744 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1813  alpha/beta hydrolase fold  34.07 
 
 		 287 aa  125  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.557453  normal  0.0116174 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2533  alpha/beta hydrolase fold  31.73 
 
 		 394 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  hitchhiker  0.000713201 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1592  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121533  normal  0.0764642 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 		 277 aa  99  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03123  hydrolase protein  28.68 
 
 		 279 aa  96.7  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0186  alpha/beta hydrolase fold protein  27.55 
 
 		 258 aa  85.9  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  23.97 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 		 267 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  30.85 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  28.03 
 
 		 263 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  27.04 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3803  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2945  alpha/beta hydrolase fold  24.51 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.238938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  26.94 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  35.34 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  37.27 
 
 		 282 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6084  hydrolase  26.36 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  27.41 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  35.4 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  26.04 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  25.53 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  27.45 
 
 		 272 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  25.86 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2333  alpha/beta fold family hydrolase  24.82 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4279  alpha/beta hydrolase fold  24.18 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52768  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.754545  normal  0.278795 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  33.06 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  23.84 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  24.81 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  23.53 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  36.59 
 
 		 372 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  36.59 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1192  alpha/beta superfamily hydrolase  31.09 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  32.06 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  24.18 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3352  alpha/beta superfamily hydrolase  23.55 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0154019  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  25.57 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  26.92 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  22.71 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  23.61 
 
 		 289 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0351  alpha/beta hydrolase fold  36.59 
 
 		 275 aa  67  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.347807 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1880  alpha/beta hydrolase fold  26.3 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000336147  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0982  alpha/beta hydrolase fold  28.05 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485669  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2128  alpha/beta hydrolase fold protein  29.79 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  38.26 
 
 		 275 aa  67  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  24.72 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  25.8 
 
 		 274 aa  67  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  22.71 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  36.07 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  36.07 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5136  alpha/beta hydrolase fold protein  23.55 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  31.45 
 
 		 562 aa  66.2  0.0000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  33.05 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  26.25 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.16 
 
 		 372 aa  66.2  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  21.8 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  34.71 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  21.8 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  23.26 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2033  alpha/beta hydrolase fold  24.55 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000295645  hitchhiker  0.000143979 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  35.77 
 
 		 328 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0369  alpha/beta hydrolase fold protein  34.82 
 
 		 262 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.598497 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  22.93 
 
 		 264 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05110  expressed protein  35.9 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8516  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  35.24 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal  0.759464 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  21.8 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  32.46 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1942  alpha/beta hydrolase fold  24.55 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000178977  hitchhiker  0.00172948 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0368  alpha/beta hydrolase fold protein  32.62 
 
 		 355 aa  65.1  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.324688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  24.35 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  21.8 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  21.56 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1799  Alpha/beta hydrolase fold  34.45 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>