More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1823 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
264 aa  525  1e-148  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.754545  normal  0.278795 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5645  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 
273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.530376  normal  0.570131 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2929  putative alpha/beta hydrolase  35.1 
 
 
277 aa  104  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0296814 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5203  alpha/beta hydrolase fold protein  30.56 
 
 
260 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112668  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3821  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
256 aa  85.9  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1132  putative hydrolase  32.56 
 
 
285 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96812  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3383  alpha/beta hydrolase fold  28.92 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5527  alpha/beta hydrolase fold  31.92 
 
 
307 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.563792  normal  0.509486 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5225  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 
283 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4694  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  31.44 
 
 
265 aa  76.3  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28630  putative hydrolase  34.54 
 
 
287 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000201744 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 
260 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2502  putative hydrolase  34.78 
 
 
283 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1609  Alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 
293 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0304  Alpha/beta hydrolase  28.4 
 
 
283 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0682  alpha/beta family hydrolase  29.89 
 
 
286 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1592  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121533  normal  0.0764642 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2137  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 
363 aa  73.2  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198184  normal  0.0171478 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2073  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 
278 aa  73.2  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.944371  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1055  alpha/beta hydrolase  27.8 
 
 
239 aa  72.8  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1827  alpha/beta hydrolase fold  22.31 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.518334  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4356  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 
283 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  26.24 
 
 
259 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4924  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 
283 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4154  alpha/beta hydrolase  27.84 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3719  alpha/beta hydrolase fold  30.52 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  hitchhiker  0.00169195 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3020  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 
283 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5346  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 
283 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00669533  normal  0.437988 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  31.66 
 
 
425 aa  68.9  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  26.4 
 
 
277 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1228  alpha/beta hydrolase fold protein  28.28 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5048  alpha/beta hydrolase fold protein  30.45 
 
 
279 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.614525  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  29.15 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.98 
 
 
343 aa  65.9  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  29.8 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4244  alpha/beta hydrolase fold  23.71 
 
 
331 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0679936  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 
295 aa  65.5  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  28.29 
 
 
275 aa  65.5  0.0000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 
275 aa  64.7  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0084  alpha/beta hydrolase fold protein  29.03 
 
 
246 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3527  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
294 aa  64.7  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6598  alpha/beta hydrolase fold protein  28.08 
 
 
283 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1813  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
287 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.557453  normal  0.0116174 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  25.19 
 
 
258 aa  63.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  27.44 
 
 
344 aa  63.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1990  alpha/beta hydrolase fold protein  28.85 
 
 
308 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000207277 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2533  alpha/beta hydrolase fold  32.79 
 
 
394 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  hitchhiker  0.000713201 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 
279 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 
300 aa  63.2  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 
279 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  25.7 
 
 
277 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  28.35 
 
 
282 aa  62.4  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 
254 aa  62  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0916  alpha/beta hydrolase fold protein  28.69 
 
 
252 aa  62  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 
272 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3950  alpha/beta hydrolase fold  25.58 
 
 
474 aa  62  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  28.51 
 
 
256 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1253  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 
336 aa  60.8  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  24.6 
 
 
264 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 
300 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  29.01 
 
 
294 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  26.74 
 
 
262 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 
275 aa  60.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5136  alpha/beta hydrolase fold protein  27.86 
 
 
291 aa  60.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1166  alpha/beta hydrolase fold protein  22.73 
 
 
333 aa  60.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5558  alpha/beta hydrolase fold protein  27.42 
 
 
227 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  29.65 
 
 
265 aa  60.5  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3502  alpha/beta hydrolase fold protein  32.41 
 
 
268 aa  60.1  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0503333  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 
277 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
262 aa  60.1  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  24.82 
 
 
381 aa  59.7  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  26.17 
 
 
275 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  28.29 
 
 
304 aa  59.3  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  25 
 
 
262 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
264 aa  59.3  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  30.2 
 
 
263 aa  59.3  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
277 aa  58.9  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 
273 aa  58.9  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  26.48 
 
 
292 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  22.18 
 
 
330 aa  58.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
270 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13227  lipase lipV  40.62 
 
 
261 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1796  alpha/beta hydrolase fold protein  23.34 
 
 
387 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.883295 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1121  alpha/beta hydrolase fold protein  35.14 
 
 
322 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  25.2 
 
 
265 aa  57.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1330  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
260 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.515623  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0327  alpha/beta hydrolase  34.03 
 
 
237 aa  57.4  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  29.53 
 
 
256 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  29.53 
 
 
256 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 
291 aa  57.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  29.53 
 
 
256 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4250  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 
352 aa  57  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.2493  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 
282 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  30.53 
 
 
271 aa  57  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2598  KR domain protein  26.7 
 
 
7149 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 
284 aa  56.6  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
277 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 
288 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>