More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0389 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 327 aa  686    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  56.84 
 
 		 289 aa  369  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  55.71 
 
 		 290 aa  352  5.9999999999999994e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  47.9 
 
 		 300 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  49.65 
 
 		 285 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  44.72 
 
 		 289 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 		 359 aa  248  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  30.62 
 
 		 305 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  30.9 
 
 		 305 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 		 309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1098  Alpha/beta hydrolase fold  28.82 
 
 		 297 aa  135  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2704  alpha/beta fold family hydrolase  29.86 
 
 		 340 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1684  alpha/beta fold family hydrolase  29.86 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.163104  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3131  alpha/beta fold family hydrolase  29.86 
 
 		 296 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2625  alpha/beta fold family hydrolase  29.86 
 
 		 296 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738195  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1459  alpha/beta fold family hydrolase  29.86 
 
 		 296 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2186  alpha/beta fold family hydrolase  29.86 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2571  alpha/beta fold family hydrolase  29.51 
 
 		 349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2011  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 296 aa  133  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219515 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2138  alpha/beta hydrolase fold  30.9 
 
 		 296 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5407  Alpha/beta hydrolase  30.21 
 
 		 296 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.632759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1173  alpha/beta hydrolase fold  30.9 
 
 		 296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.95564  decreased coverage  0.000000135804 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2119  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 		 296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5976  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2101  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2554  alpha/beta hydrolase fold  30.21 
 
 		 294 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000366635  normal  0.152292 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 		 289 aa  129  7.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1900  alpha/beta fold family hydrolase  29.51 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1579  putative hydrolase  29.86 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144323  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  32.66 
 
 		 289 aa  126  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0437  alpha/beta hydrolase fold protein  29.56 
 
 		 300 aa  124  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.885291  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1135  putative hydrolase protein  28.62 
 
 		 307 aa  123  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 		 295 aa  122  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3775  alpha/beta hydrolase fold protein  28.3 
 
 		 309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 		 311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  29.85 
 
 		 282 aa  119  7e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  29.48 
 
 		 282 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1433  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1153  alpha/beta hydrolase fold  30.16 
 
 		 307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1062  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 		 297 aa  116  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00192187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 		 311 aa  116  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  32.04 
 
 		 299 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  32.04 
 
 		 299 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2772  putative hydrolase protein  28.71 
 
 		 312 aa  114  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2699  alpha/beta hydrolase  27.89 
 
 		 299 aa  112  9e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3251  alpha/beta hydrolase fold  31.51 
 
 		 292 aa  109  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0874027  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4804  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  27.78 
 
 		 300 aa  106  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1589  alpha/beta hydrolase fold  27.42 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1074  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1767  alpha/beta hydrolase fold  26.3 
 
 		 339 aa  102  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963183 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  27.63 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  27.45 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  27.45 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2124  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 		 294 aa  99.8  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321379 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  26.97 
 
 		 300 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  32.5 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 		 285 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  26.97 
 
 		 300 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  26.97 
 
 		 300 aa  97.4  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 		 306 aa  97.1  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  26.64 
 
 		 300 aa  96.7  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  26.64 
 
 		 300 aa  96.7  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  31.53 
 
 		 288 aa  95.1  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  26.46 
 
 		 2762 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  26.14 
 
 		 300 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  30.41 
 
 		 288 aa  93.2  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 		 288 aa  92.8  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 		 288 aa  92.8  8e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.08 
 
 		 265 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 280 aa  90.9  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4953  alpha/beta hydrolase fold  25.89 
 
 		 360 aa  90.1  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  26.09 
 
 		 257 aa  89.7  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 288 aa  89.4  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 288 aa  89.4  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 		 284 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7313  Alpha/beta hydrolase fold  27.12 
 
 		 303 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4164  alpha/beta fold family hydrolase  26.41 
 
 		 284 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01136  hydrolase, alpha/beta fold family protein  27.08 
 
 		 279 aa  88.2  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3232  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 		 303 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3283  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 		 303 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2109  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 		 294 aa  87.4  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139583  normal  0.535795 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3221  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 		 303 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  26.81 
 
 		 306 aa  87  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 		 288 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3736  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 		 284 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4202  epoxide hydrolase  28.14 
 
 		 284 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  29.57 
 
 		 288 aa  86.7  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2766  non-heme peroxidase  27.21 
 
 		 293 aa  86.7  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  23.74 
 
 		 258 aa  86.7  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 308 aa  86.3  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1703  alpha/beta hydrolase fold  26.41 
 
 		 284 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 288 aa  85.9  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  24.18 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 		 284 aa  85.5  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 294 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 		 287 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03843  hydrolase  30.34 
 
 		 244 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>