More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2120 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
284 aa  591  1e-168  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.466438 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4536  alpha/beta hydrolase fold protein  50.36 
 
 
279 aa  293  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.0123379 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1299  hypothetical protein  51.98 
 
 
262 aa  280  1e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000570356  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5414  alpha/beta hydrolase fold protein  49.61 
 
 
261 aa  272  4.0000000000000004e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  44.19 
 
 
284 aa  262  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  43.49 
 
 
287 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  48.44 
 
 
273 aa  257  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  43.02 
 
 
284 aa  255  6e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  42.64 
 
 
284 aa  251  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3585  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 
270 aa  192  8e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 
279 aa  176  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0653  alpha/beta hydrolase fold protein  36.7 
 
 
310 aa  155  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.754721  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2025  alpha/beta hydrolase fold protein  37.02 
 
 
276 aa  148  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1790  alpha/beta hydrolase fold  32.78 
 
 
287 aa  142  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.333084  hitchhiker  0.00365614 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3368  alpha/beta hydrolase fold protein  35.27 
 
 
326 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4208  alpha/beta hydrolase fold protein  36.18 
 
 
268 aa  136  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3293  alpha/beta hydrolase fold  35.02 
 
 
323 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104393  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  37.33 
 
 
259 aa  136  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3365  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.6363  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3177  Alpha/beta hydrolase fold-1  35.06 
 
 
272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.97494  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3606  alpha/beta hydrolase fold  34.02 
 
 
265 aa  132  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0737  alpha/beta hydrolase fold protein  33.46 
 
 
273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.755425  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3027  alpha/beta hydrolase fold protein  30.48 
 
 
285 aa  126  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  33.06 
 
 
263 aa  123  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  31.38 
 
 
286 aa  118  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  31.36 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2639  alpha/beta hydrolase fold  31.51 
 
 
280 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2684  alpha/beta hydrolase fold  31.51 
 
 
280 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.9064  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1509  alpha/beta hydrolase fold  34.78 
 
 
261 aa  112  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.725835  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1106  alpha/beta hydrolase fold protein  34.02 
 
 
283 aa  112  9e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.112481  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2668  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 
280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105125  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1367  alpha/beta hydrolase fold  34.71 
 
 
310 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1470  alpha/beta hydrolase fold protein  34.16 
 
 
315 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5863  alpha/beta hydrolase fold protein  33.64 
 
 
265 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.279453 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  26.24 
 
 
282 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1534  lipolytic enzyme  29.35 
 
 
294 aa  102  6e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.277395  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0017  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 
327 aa  101  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0512561 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  29.86 
 
 
279 aa  99  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  29.69 
 
 
425 aa  99  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  30.88 
 
 
233 aa  97.1  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  31.17 
 
 
280 aa  97.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  26.22 
 
 
283 aa  96.3  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2090  putative hydrolase  30.39 
 
 
233 aa  95.9  7e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  33.64 
 
 
270 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 
279 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.73 
 
 
265 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 
270 aa  92.8  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1287  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 
255 aa  92.4  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00130508  normal  0.0205637 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  34.26 
 
 
270 aa  92  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  26.13 
 
 
283 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  32.26 
 
 
270 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  25.77 
 
 
296 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0099  alpha/beta fold family hydrolase  23.64 
 
 
220 aa  87.8  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000675213 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 
264 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  26.2 
 
 
270 aa  86.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  33.8 
 
 
262 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  25.19 
 
 
296 aa  86.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  31.8 
 
 
270 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  26.03 
 
 
296 aa  85.9  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  26.03 
 
 
296 aa  85.9  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  28.44 
 
 
226 aa  84.3  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  24.41 
 
 
272 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  30.37 
 
 
284 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  25.11 
 
 
271 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  23.53 
 
 
267 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  25 
 
 
281 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6102  alpha/beta hydrolase fold  26.54 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1067  alpha/beta hydrolase fold protein  26.09 
 
 
239 aa  80.1  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  28.08 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 
302 aa  79.7  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
252 aa  79  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  28.86 
 
 
275 aa  79  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  44.21 
 
 
271 aa  78.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  36.21 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  31.08 
 
 
277 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 
298 aa  77.4  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  24.61 
 
 
264 aa  77  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  28.64 
 
 
267 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  36.75 
 
 
298 aa  77  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  26.27 
 
 
286 aa  75.9  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.73231  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  35.62 
 
 
299 aa  75.5  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  26.07 
 
 
264 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  27.71 
 
 
278 aa  75.1  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  27.14 
 
 
263 aa  75.1  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0888  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 
282 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2612  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 
250 aa  74.3  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  0.0292589 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  35.65 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1808  hypothetical protein  25 
 
 
219 aa  74.3  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  26.27 
 
 
276 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  25.42 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3736  alpha/beta hydrolase fold  27.63 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265867  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0977  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  22.52 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.245429  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  33.07 
 
 
277 aa  72.4  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  37.07 
 
 
269 aa  72.8  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 
278 aa  72.8  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  24.7 
 
 
271 aa  72.4  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2555  alpha/beta hydrolase fold protein  24.19 
 
 
234 aa  72  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.249679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>