More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0977 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0977  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  100 
 
 		 266 aa  530  1e-149  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.245429  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2555  alpha/beta hydrolase fold protein  39.74 
 
 		 234 aa  205  7e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.249679  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  35.97 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  33.73 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  29.18 
 
 		 270 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 272 aa  105  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 		 270 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  28.34 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  26.77 
 
 		 276 aa  99  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 		 270 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 		 270 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  27.13 
 
 		 281 aa  97.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  25.9 
 
 		 286 aa  96.7  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 270 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6102  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 		 270 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 		 287 aa  90.5  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  27.27 
 
 		 279 aa  90.5  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 		 279 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  31.56 
 
 		 284 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3907  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 		 269 aa  86.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804884  normal  0.943348 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4021  alpha/beta hydrolase fold protein  27.13 
 
 		 269 aa  86.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.000000197083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 		 273 aa  86.3  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 		 284 aa  86.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  30.98 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  26.29 
 
 		 279 aa  83.2  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5414  alpha/beta hydrolase fold protein  25.32 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1287  alpha/beta hydrolase fold protein  28.07 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00130508  normal  0.0205637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3027  alpha/beta hydrolase fold protein  25.48 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  23.44 
 
 		 425 aa  79.3  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  22.55 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  22.55 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  22.81 
 
 		 283 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4536  alpha/beta hydrolase fold protein  27.51 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.0123379 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  22.91 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  22.18 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  21.82 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  25.29 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  23.37 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  24.42 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  24.1 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  22.69 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  22.52 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.466438 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1299  hypothetical protein  23.68 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000570356  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  25.31 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  23.28 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1790  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.333084  hitchhiker  0.00365614 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  22.58 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0653  alpha/beta hydrolase fold protein  26.49 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.754721  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  26.69 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  26.29 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  26.51 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1182  3-oxoadipate enol-lactonase  25.66 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2132  hypothetical protein  26.61 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1692  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155751 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1808  hypothetical protein  21.79 
 
 		 219 aa  67  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0099  alpha/beta fold family hydrolase  23.04 
 
 		 220 aa  67  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000675213 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  29.93 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18880  hydrolase, alpha/beta fold family  27.88 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481755  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  25.8 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  26.54 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  24.21 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1773  alpha/beta hydrolase fold  23.28 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000223645  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  22.09 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1824  alpha/beta hydrolase fold  23.9 
 
 		 332 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.459481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  32.72 
 
 		 298 aa  62  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  23.83 
 
 		 277 aa  62  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  24.61 
 
 		 264 aa  62  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  36.28 
 
 		 256 aa  62  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  22.22 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  24.07 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  27.13 
 
 		 229 aa  62  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  35.19 
 
 		 308 aa  62  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  24.3 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  23.88 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2332  alpha/beta hydrolase fold  25.66 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0923  alpha/beta hydrolase fold protein  29.03 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1465  alpha/beta hydrolase fold protein  27 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.647363  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  22.88 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1586  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  25.96 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0950  alpha/beta hydrolase fold protein  29.03 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2201  alpha/beta fold family hydrolase  23.9 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  23.02 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  23.02 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  24.6 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  25.59 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5227  alpha/beta hydrolase fold protein  25.58 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.968895  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2231  alpha/beta hydrolase fold  24.7 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0937433  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1050  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.173196  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  25.7 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2516  hydrolase, alpha/beta fold family  24.89 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>