More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1050 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1050  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
322 aa  667    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.173196  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.56 
 
 
351 aa  145  6e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.84065  normal  0.959468 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0343  alpha/beta fold family hydrolase  30.77 
 
 
372 aa  135  9.999999999999999e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3008  hydrolase  35.69 
 
 
319 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2678  alpha/beta hydrolase fold protein  27.52 
 
 
333 aa  115  6.9999999999999995e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.906981 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4640  hypothetical protein  49.19 
 
 
280 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.376604  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4126  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 
393 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000164833  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  25.97 
 
 
396 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  24.5 
 
 
258 aa  72.8  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 
298 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 
265 aa  71.2  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1692  alpha/beta hydrolase fold protein  35.34 
 
 
239 aa  70.1  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.155751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  34.43 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  35.34 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  25.08 
 
 
392 aa  69.7  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  24.83 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2242  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
301 aa  69.7  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.545637  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  33.63 
 
 
285 aa  69.3  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  32.17 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  32.77 
 
 
259 aa  68.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  33.04 
 
 
229 aa  67.8  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  26.28 
 
 
324 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  34.48 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  34.82 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  36.36 
 
 
285 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  30.41 
 
 
263 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6597  alpha/beta hydrolase fold protein  24.68 
 
 
301 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446556  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 
272 aa  67  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0923  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0950  alpha/beta hydrolase fold protein  32.32 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  33.85 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  37.17 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2323  alpha/beta hydrolase fold protein  33.93 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.262735  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  29.91 
 
 
296 aa  65.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 
280 aa  66.2  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  35.9 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  32.43 
 
 
265 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2479  alpha/beta hydrolase fold  35.42 
 
 
277 aa  65.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0672  alpha/beta hydrolase superfamily protein  37.27 
 
 
344 aa  65.1  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0529058  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  29.91 
 
 
296 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  30.72 
 
 
296 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  29.91 
 
 
296 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  32.43 
 
 
397 aa  65.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  35.58 
 
 
273 aa  64.7  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3102  Alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
312 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.6937 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 
288 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  23.47 
 
 
265 aa  64.3  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  35.45 
 
 
300 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  24.68 
 
 
268 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2073  alpha/beta hydrolase fold protein  31.97 
 
 
229 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  29.17 
 
 
262 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4195  alpha/beta hydrolase fold protein  33.02 
 
 
308 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2496  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 
277 aa  63.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  31.48 
 
 
296 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1226  alpha/beta hydrolase fold protein  29.91 
 
 
292 aa  63.5  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00330311  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  25.64 
 
 
263 aa  63.5  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  33.64 
 
 
311 aa  63.2  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0801  alpha/beta hydrolase fold protein  33.98 
 
 
305 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4676  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  32.8 
 
 
331 aa  63.2  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318593  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  23.08 
 
 
282 aa  63.2  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1380  3-oxoadipate enol-lactonase  32.31 
 
 
263 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.595814 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  27.91 
 
 
300 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  33.63 
 
 
263 aa  62.8  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4343  3-oxoadipate enol-lactonase  32.31 
 
 
263 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149189  normal  0.0581646 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 
300 aa  62  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 
252 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  30.97 
 
 
261 aa  62  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3567  3-oxoadipate enol-lactonase  31.03 
 
 
264 aa  62.4  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0409722 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  33.01 
 
 
305 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3210  alpha/beta hydrolase fold protein  35.34 
 
 
271 aa  62  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.45774  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0200  alpha/beta hydrolase fold protein  36.61 
 
 
251 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127283  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4430  alpha/beta fold family hydrolase  31.45 
 
 
287 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1581  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
259 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4196  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 
294 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  32.69 
 
 
265 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  33.94 
 
 
266 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4088  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
309 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.90454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  30.08 
 
 
265 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  27.13 
 
 
300 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  25.4 
 
 
267 aa  60.8  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 
267 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  35.92 
 
 
289 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  35.05 
 
 
285 aa  60.8  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3071  alpha/beta hydrolase fold  36.27 
 
 
290 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.357729  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  33.64 
 
 
263 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  31.03 
 
 
260 aa  60.5  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  27.13 
 
 
300 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  27.13 
 
 
300 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  27.13 
 
 
300 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  27.13 
 
 
300 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  27.13 
 
 
300 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  27.13 
 
 
300 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0977  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  31.21 
 
 
266 aa  60.1  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.245429  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  29.82 
 
 
275 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0442  alpha/beta hydrolase fold protein  32.35 
 
 
334 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.471208 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4095  alpha/beta fold family hydrolase  30.65 
 
 
294 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787751  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2516  hydrolase, alpha/beta fold family  36.51 
 
 
242 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018154  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  31.78 
 
 
262 aa  60.1  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00660  Alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
280 aa  59.7  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>