More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4126 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4126  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 393 aa  785    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000164833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1050  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 		 322 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.173196  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0343  alpha/beta fold family hydrolase  34.48 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  35.11 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.84065  normal  0.959468 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3008  hydrolase  37.88 
 
 		 319 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3907  alpha/beta hydrolase fold  42.42 
 
 		 294 aa  66.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  34.13 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  36.28 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0479  alpha/beta hydrolase fold  36.15 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  35.96 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  36.28 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 		 265 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  38.84 
 
 		 285 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  38.53 
 
 		 299 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  38.53 
 
 		 299 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  37.17 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  38.02 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  36.73 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  41.18 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  38.05 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  42.11 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  31.1 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0774  esterase  33.81 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.391328  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  30.67 
 
 		 268 aa  57  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2631  alpha/beta hydrolase fold protein  29.68 
 
 		 268 aa  57  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  30.25 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  36.08 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2101  alpha/beta hydrolase fold  37.31 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1735  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  31.86 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1699  putative hydrolase  32.48 
 
 		 312 aa  55.8  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  34.4 
 
 		 311 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  33.63 
 
 		 270 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  35.09 
 
 		 387 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  36.73 
 
 		 271 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  33.61 
 
 		 315 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  33.61 
 
 		 315 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  41.35 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3856  alpha/beta hydrolase fold  33.65 
 
 		 266 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.76945  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0991  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 		 389 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  hitchhiker  0.00638838 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00660  Alpha/beta hydrolase fold protein  33.06 
 
 		 280 aa  54.7  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1142  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  35.71 
 
 		 390 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.152589  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  34.31 
 
 		 396 aa  54.7  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  35.54 
 
 		 266 aa  54.7  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13510  peroxidase bpoA (non-haem peroxidase)  37.25 
 
 		 289 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  33.61 
 
 		 300 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  33.61 
 
 		 300 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  33.61 
 
 		 300 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  33.61 
 
 		 300 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2496  alpha/beta hydrolase fold protein  39.6 
 
 		 277 aa  54.3  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 		 275 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  25.84 
 
 		 278 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  34.65 
 
 		 271 aa  53.5  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1897  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 		 264 aa  53.5  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.595115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  34.26 
 
 		 275 aa  53.1  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2541  alpha/beta hydrolase fold  30.81 
 
 		 315 aa  53.5  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2479  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 		 277 aa  53.1  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1712  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 373 aa  53.1  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  34.69 
 
 		 260 aa  53.1  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1396  alpha/beta hydrolase fold  39.39 
 
 		 298 aa  53.1  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  33.61 
 
 		 300 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2678  alpha/beta hydrolase fold protein  35.24 
 
 		 333 aa  52.8  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.906981 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  37.37 
 
 		 289 aa  53.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2657  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 		 276 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  32.5 
 
 		 300 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4612  Alpha/beta hydrolase  38.38 
 
 		 298 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00157572  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3081  alpha/beta hydrolase fold protein  28.9 
 
 		 371 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0542902  normal  0.696639 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2603  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 		 276 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  34.65 
 
 		 263 aa  52.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 		 258 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0987  alpha/beta hydrolase fold  27.75 
 
 		 298 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  32.73 
 
 		 296 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  32.73 
 
 		 296 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4827  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 		 352 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.692638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  29.08 
 
 		 260 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  32.73 
 
 		 296 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4640  hypothetical protein  34.06 
 
 		 280 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.376604  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  33.33 
 
 		 275 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  31.06 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5500  putative prolyl aminopeptidase  39.18 
 
 		 291 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0980519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  32.73 
 
 		 296 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 		 289 aa  51.6  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2097  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 		 281 aa  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.421865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1356  alpha/beta hydrolase fold  38.78 
 
 		 297 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  36.63 
 
 		 259 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_3905  predicted protein  29.73 
 
 		 272 aa  51.6  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.655123  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04531  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02920)  31.25 
 
 		 510 aa  51.2  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00644571 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4122  alpha/beta hydrolase fold protein  33.06 
 
 		 287 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  32.79 
 
 		 300 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6440  alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 		 268 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  32.26 
 
 		 275 aa  51.2  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  34.51 
 
 		 267 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  30.92 
 
 		 278 aa  51.2  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 283 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  31.09 
 
 		 262 aa  51.2  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  34.34 
 
 		 263 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 		 285 aa  50.8  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  30.39 
 
 		 261 aa  50.8  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>