More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0479 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0479  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 308 aa  634    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0252  alpha/beta hydrolase fold  44 
 
 		 305 aa  226  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  43.33 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0880  alpha/beta hydrolase fold  43.06 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0430  alpha/beta hydrolase fold  39.79 
 
 		 300 aa  181  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0592  alpha/beta hydrolase fold  38.97 
 
 		 300 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1673  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 		 296 aa  158  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478799  normal  0.0522844 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2047  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 		 261 aa  107  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4240  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 		 296 aa  106  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.033675  hitchhiker  0.000000334465 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1750  alpha/beta hydrolase fold  29.87 
 
 		 290 aa  102  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99004  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 		 279 aa  98.6  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4105  hypothetical protein  29.41 
 
 		 301 aa  97.4  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.710482  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72750  hypothetical protein  30.07 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6315  hypothetical protein  32.48 
 
 		 292 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2460  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 		 267 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2542  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 294 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897918 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1702  hypothetical protein  28.78 
 
 		 287 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1570  putative hydrolase  27.37 
 
 		 267 aa  94  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2933  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 		 279 aa  94  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0612634  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2563  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 267 aa  92.4  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19966  normal  0.119166 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2106  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 292 aa  92.4  8e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2450  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 		 289 aa  92.4  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4532  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 292 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2333  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 		 289 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4165  hypothetical protein  28.94 
 
 		 287 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2013  alpha/beta hydrolase fold protein  30.63 
 
 		 289 aa  89.7  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.096927  hitchhiker  0.0025286 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1872  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 		 292 aa  89.7  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3404  alpha/beta hydrolase fold  29.68 
 
 		 290 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.375307 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1891  hypothetical protein  28.57 
 
 		 275 aa  88.6  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1830  alpha/beta hydrolase  28.46 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2714  hydrolase  28.57 
 
 		 275 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2045  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 		 275 aa  87  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2635  hypothetical protein  28.57 
 
 		 275 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348998  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1087  alpha/beta fold hydrolase  27.44 
 
 		 268 aa  87  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2358  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 290 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02422  acyltransferase 3  27.55 
 
 		 267 aa  86.3  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1692  hypothetical protein  28.19 
 
 		 275 aa  85.9  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.959069  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1469  hypothetical protein  28.19 
 
 		 275 aa  85.9  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.816074  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3122  hypothetical protein  28.19 
 
 		 275 aa  85.9  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.798487  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.33 
 
 		 305 aa  86.3  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2196  hypothetical protein  28.19 
 
 		 275 aa  85.9  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.446951  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2452  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 		 290 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1692  hypothetical protein  26.34 
 
 		 261 aa  85.5  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0787  hydrolase  26.01 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43550  putative hydrolase  28.52 
 
 		 270 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2580  hypothetical protein  28.19 
 
 		 275 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1691  hypothetical protein  26.34 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3490  alpha/beta fold family hydrolase  28.57 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1442  alpha/beta hydrolase fold protein  27.8 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3591  hypothetical protein  28.35 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4203  Alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0793  putative hydrolase  25.64 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3737  alpha/beta fold family hydrolase  27.88 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2026  hypothetical protein  27.5 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.852935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5416  hypothetical protein  28.85 
 
 		 281 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3652  putative hydrolase  28.09 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5967  hypothetical protein  27.44 
 
 		 281 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.895466  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.722843  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2110  hypothetical protein  27.44 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0833306  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2128  hypothetical protein  27.44 
 
 		 281 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00833807  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1160  hypothetical protein  28.41 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485022 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2217  hypothetical protein  27.44 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105926  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  28.84 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.252363  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0968  putative hydrolase protein  29.3 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1125  putative hydrolase protein  30.43 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1154  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2020  hypothetical protein  28.08 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0898087 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2147  hypothetical protein  28.08 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0977369  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1064  alpha/beta hydrolase fold protein  28.94 
 
 		 273 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1678  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0849008  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1736  hypothetical protein  26.49 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000795767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1051  alpha/beta hydrolase fold  32.39 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2272  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 		 286 aa  75.1  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0854176 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3552  alpha/beta hydrolase fold protein  30.41 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336946  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3339  hypothetical protein  26.79 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2844  hypothetical protein  28.73 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 352 aa  69.3  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  27.44 
 
 		 387 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1357  hypothetical protein  27.17 
 
 		 283 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0861154 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0089  alpha/beta hydrolase fold  23.83 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2022  alpha/beta hydrolase fold  23.73 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.560184  normal  0.215859 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  27.11 
 
 		 387 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  37.6 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  27.17 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  28.16 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4252  alpha/beta hydrolase fold  26.53 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.733578  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  26.03 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3526  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  34.4 
 
 		 275 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  34.4 
 
 		 275 aa  62.4  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2685  Alpha/beta hydrolase fold  31.95 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.117694  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1389  alpha/beta hydrolase fold protein  31.78 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.48672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  30.43 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0888  alpha/beta hydrolase fold  24.92 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109453  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3651  putative hydrolase  30.04 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1534  alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0162186  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4126  alpha/beta hydrolase fold  36.07 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000164833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3102  Alpha/beta hydrolase fold  31.93 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.6937 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  26.86 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>