More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1699 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1699  putative hydrolase  100 
 
 		 312 aa  607  1e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0457  alpha/beta hydrolase fold protein  48.07 
 
 		 299 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4827  alpha/beta hydrolase fold protein  43.36 
 
 		 352 aa  199  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.692638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0777  alpha/beta hydrolase fold protein  39.09 
 
 		 347 aa  177  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3656  alpha/beta hydrolase fold protein  39.26 
 
 		 347 aa  158  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1865  alpha/beta hydrolase fold  35.64 
 
 		 325 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0853648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1142  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  39.09 
 
 		 390 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.152589  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1525  alpha/beta hydrolase fold  37.05 
 
 		 318 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0190867  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1579  alpha/beta hydrolase fold  36.72 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1555  alpha/beta hydrolase fold  36.72 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4502  alpha/beta hydrolase fold  35.95 
 
 		 353 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.297988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13192  non-heme haloperoxidase hpx  34.83 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.305997 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  37.11 
 
 		 350 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.38332 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0541  alpha/beta hydrolase fold protein  37.77 
 
 		 344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.271487 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0625  alpha/beta hydrolase fold  38.08 
 
 		 423 aa  125  7e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1497  alpha/beta hydrolase fold protein  35.78 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  37.38 
 
 		 397 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3629  alpha/beta hydrolase fold  37.07 
 
 		 306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030304  hitchhiker  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0254  alpha/beta hydrolase fold protein  34.92 
 
 		 348 aa  112  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1174  alpha/beta hydrolase fold  32.88 
 
 		 369 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326598  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1147  alpha/beta hydrolase fold  32.88 
 
 		 369 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255082  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1164  alpha/beta hydrolase fold  32.88 
 
 		 369 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.428268 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4266  alpha/beta hydrolase fold protein  34.23 
 
 		 364 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3387  alpha/beta hydrolase fold  35.43 
 
 		 306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  37.24 
 
 		 304 aa  108  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06710  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  37.24 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0728  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000117195  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4933  alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 		 362 aa  106  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1485  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 		 362 aa  105  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.409347  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1712  alpha/beta hydrolase fold protein  31.39 
 
 		 373 aa  101  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04600  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  35.08 
 
 		 330 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.374511 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6010  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 		 421 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773155  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0560  alpha/beta hydrolase fold protein  35.2 
 
 		 390 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0901  alpha/beta hydrolase fold  33.98 
 
 		 360 aa  100  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6555  alpha/beta hydrolase fold protein  33.02 
 
 		 366 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381661  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6786  alpha/beta hydrolase fold  33.94 
 
 		 297 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0991  alpha/beta hydrolase fold protein  28.96 
 
 		 389 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  hitchhiker  0.00638838 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1191  alpha/beta hydrolase fold protein  31.27 
 
 		 400 aa  93.6  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0879  alpha/beta hydrolase fold protein  32.21 
 
 		 349 aa  90.1  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5476  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 		 333 aa  89  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294136  normal  0.797092 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3856  alpha/beta hydrolase fold  32.8 
 
 		 364 aa  85.9  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775297  normal  0.514851 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  30.69 
 
 		 264 aa  86.3  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2172  Alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29020  chloroperoxidase precursor  26.96 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.995557  hitchhiker  0.000198264 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  31.41 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  31.52 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  30.92 
 
 		 265 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  26.8 
 
 		 273 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  31.3 
 
 		 264 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  30.58 
 
 		 262 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12242  short chain dehydrogenase  26.46 
 
 		 592 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0208017  normal  0.29752 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4122  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3995  chloroperoxidase precursor  26.28 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  31.14 
 
 		 363 aa  78.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1692  3-oxoadipate enol-lactonase  29.51 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4028  alpha/beta hydrolase fold  28.01 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0704  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.166516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  27.84 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  31.95 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  29.5 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  30.29 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 		 316 aa  76.6  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  25.84 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5684  alpha/beta hydrolase fold  26.3 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6048  alpha/beta hydrolase fold  26.3 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.850826 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3626  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  28.15 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  25.5 
 
 		 324 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  32.05 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7479  Alpha/beta hydrolase  26.3 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  32.04 
 
 		 266 aa  75.5  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1700  alpha/beta hydrolase fold  25.69 
 
 		 276 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1303  chloride peroxidase  28.68 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199298  normal  0.019602 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1286  chloride peroxidase  28.68 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4246  alpha/beta hydrolase fold  32.59 
 
 		 364 aa  73.9  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146629  hitchhiker  0.00549727 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4016  alpha/beta hydrolase fold  41.27 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459613  normal  0.722956 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3216  alpha/beta hydrolase fold  29.47 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0194  Alpha/beta hydrolase  27.21 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  24.83 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  29 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5410  alpha/beta hydrolase fold protein  23.75 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3458  Alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  30.82 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  0.0190305 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4071  alpha/beta hydrolase fold  40.16 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4021  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 276 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.425727  normal  0.727928 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  26.51 
 
 		 330 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  27.69 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  28.47 
 
 		 396 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3040  alpha/beta fold family hydrolase  30.15 
 
 		 258 aa  72.4  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  28.83 
 
 		 392 aa  72  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1812  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 276 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0465722  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0608  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 		 311 aa  71.6  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000717376  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2287  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0344  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>