More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0343 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0343  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 		 372 aa  768    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.8 
 
 		 351 aa  189  7e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.84065  normal  0.959468 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2678  alpha/beta hydrolase fold protein  34.54 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.906981 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1050  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 322 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.173196  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3008  hydrolase  24.09 
 
 		 319 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4640  hypothetical protein  36.44 
 
 		 280 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.376604  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4126  alpha/beta hydrolase fold  34.75 
 
 		 393 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000164833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 		 285 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1701  alpha/beta hydrolase fold protein  35.34 
 
 		 303 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1726  alpha/beta hydrolase fold protein  35.34 
 
 		 303 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0626  Alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1226  alpha/beta hydrolase fold protein  30.91 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00330311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  32.8 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  34.17 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0068  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  32.73 
 
 		 297 aa  65.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2011  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  31.88 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0062  alpha/beta hydrolase fold protein  29.49 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  32.46 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  24.07 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  31.37 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  30.97 
 
 		 300 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  30.17 
 
 		 290 aa  62.8  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 		 269 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  25.88 
 
 		 309 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  25.88 
 
 		 309 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  25.88 
 
 		 309 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  30.09 
 
 		 268 aa  62.4  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  27 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  33.04 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  30.97 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1174  alpha/beta fold family hydrolase  33.61 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  30.97 
 
 		 300 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  27.61 
 
 		 287 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  23.42 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1487  alpha/beta hydrolase fold protein  32.48 
 
 		 267 aa  62  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.672056  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2891  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.265351 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5072  alpha/beta hydrolase fold protein  32.81 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157677 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  30.09 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  28.04 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20491  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  33.61 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.79696 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  30.97 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  30.97 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  30.97 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  30.97 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004091  predicted hydrolase/acyltransferase  29.63 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  30.97 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1744  alpha/beta hydrolase fold protein  24.02 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0831035  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3549  HOMODA hydrolase (CmtE)  28.97 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.113442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  21.97 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0244  alpha/beta hydrolase fold protein  27.64 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  29.81 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2433  hypothetical protein  28.46 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4195  alpha/beta hydrolase fold protein  29.03 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  31.39 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  31.39 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  27.85 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  31.13 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1555  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1525  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0190867  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1579  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  30.63 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  32.04 
 
 		 260 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3102  Alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 		 312 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.6937 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4202  epoxide hydrolase  30.08 
 
 		 284 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  30.09 
 
 		 271 aa  59.3  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.3 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  30.97 
 
 		 300 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  30.56 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0537  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  30.83 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.169084  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2073  alpha/beta hydrolase fold protein  32.41 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01378  hypothetical protein  28.68 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 252 aa  58.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  28.81 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0493  alpha/beta hydrolase fold  34.31 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.5355  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  19.61 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4676  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  29.53 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318593  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4088  alpha/beta hydrolase fold protein  26.96 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.90454  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  30.61 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  27.36 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  25.89 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  32.71 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3569  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0939994  normal  0.0434942 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  29.71 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  28.35 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3284  alpha/beta hydrolase fold protein  28.1 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  28.32 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37370  predicted protein  34.48 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.273183  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3092  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 		 309 aa  57  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  34.23 
 
 		 276 aa  57  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  26.49 
 
 		 335 aa  57  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>