More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2891 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_2891  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
288 aa  591  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.265351 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3549  HOMODA hydrolase (CmtE)  83.62 
 
 
301 aa  509  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.113442 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  34.72 
 
 
288 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  35.93 
 
 
293 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
288 aa  157  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
287 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
287 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
287 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  37.12 
 
 
316 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  37.12 
 
 
299 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1652  alpha/beta hydrolase fold  36.79 
 
 
299 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5609  alpha/beta hydrolase fold  36.79 
 
 
299 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333622  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1679  alpha/beta hydrolase fold  36.79 
 
 
299 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1708  alpha/beta hydrolase fold  36.79 
 
 
299 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456043  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0627  alpha/beta hydrolase fold  36.79 
 
 
299 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0545  alpha/beta hydrolase fold  36.79 
 
 
299 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0538  alpha/beta hydrolase fold  36.45 
 
 
299 aa  151  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.282885  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  32.64 
 
 
295 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4067  alpha/beta hydrolase fold  30.72 
 
 
304 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241995  normal  0.431683 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  31.76 
 
 
299 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  31.76 
 
 
299 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  31.76 
 
 
299 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  29.86 
 
 
289 aa  106  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 
294 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  29.07 
 
 
291 aa  103  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  34.2 
 
 
273 aa  99  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  30.41 
 
 
295 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1002  alpha/beta family hydrolase  26.8 
 
 
292 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  27.3 
 
 
287 aa  96.3  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  29.75 
 
 
276 aa  93.6  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
309 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  29.85 
 
 
288 aa  92  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  27.47 
 
 
293 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 
291 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 
291 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 
291 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 
279 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 
283 aa  88.6  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1447  alpha/beta hydrolase fold protein  40.74 
 
 
271 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 
277 aa  87.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 
276 aa  85.9  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 
278 aa  85.9  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.44 
 
 
369 aa  85.1  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  30.74 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  30.27 
 
 
304 aa  84  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  28.01 
 
 
286 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  30.83 
 
 
304 aa  82.4  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 
283 aa  81.6  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.01 
 
 
367 aa  81.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  28.18 
 
 
284 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  28.15 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 
283 aa  80.1  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  26.83 
 
 
288 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.47 
 
 
374 aa  79.7  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  27.15 
 
 
283 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  27.15 
 
 
283 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 
274 aa  79.3  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.34 
 
 
371 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.34 
 
 
371 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  27.37 
 
 
288 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 
350 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.71 
 
 
372 aa  78.2  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  36.43 
 
 
292 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 
286 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.46 
 
 
380 aa  77.8  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  41.28 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.34 
 
 
371 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.37 
 
 
293 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  27.37 
 
 
293 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 
273 aa  77.4  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.37 
 
 
293 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  38.68 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.37 
 
 
293 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.37 
 
 
288 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 
288 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.37 
 
 
288 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  39.45 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  40.18 
 
 
301 aa  76.6  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  35.61 
 
 
290 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.68 
 
 
370 aa  76.3  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  35.06 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  27.27 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  35.06 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  27.27 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  35.4 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.57 
 
 
370 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  35.4 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 
271 aa  75.9  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.11 
 
 
372 aa  75.5  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  39.32 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  35.06 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  35.06 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  35.06 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  35.06 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  36.28 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  36.28 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  36.28 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  34.44 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  34.4 
 
 
322 aa  75.5  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>