More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2073 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2073  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
229 aa  462  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1692  alpha/beta hydrolase fold protein  46.6 
 
 
239 aa  161  7e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.155751 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  36.28 
 
 
229 aa  124  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3797  alpha/beta hydrolase fold protein  33.63 
 
 
248 aa  101  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  34.63 
 
 
250 aa  96.7  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  29.08 
 
 
287 aa  86.3  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  27.21 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 
268 aa  82  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 
263 aa  81.6  0.000000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  27.86 
 
 
285 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  32.05 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4252  alpha/beta hydrolase fold  38.35 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.733578  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  27.91 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 
316 aa  80.1  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1808  hypothetical protein  27.94 
 
 
219 aa  78.6  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  30.13 
 
 
262 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1683  hydrolase  27.84 
 
 
257 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000746451  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  31.88 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  31.36 
 
 
408 aa  77  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  28.34 
 
 
258 aa  77  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  27.63 
 
 
281 aa  77  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 
301 aa  75.5  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3826  3-oxoadipate enol-lactonase  27.03 
 
 
265 aa  75.5  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  27.97 
 
 
262 aa  75.5  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  29.34 
 
 
571 aa  75.5  0.0000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 
272 aa  75.1  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 
272 aa  75.1  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  30.41 
 
 
226 aa  74.3  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  29.66 
 
 
387 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1572  alpha/beta hydrolase fold  31.87 
 
 
281 aa  74.7  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  26.18 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  32.46 
 
 
300 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2863  alpha/beta hydrolase fold protein  39.52 
 
 
314 aa  73.2  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.334442  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8768  putative hydrolase  28.02 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  27.06 
 
 
258 aa  72.8  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 
361 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
288 aa  72.8  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01343  hypothetical protein  26.98 
 
 
255 aa  72.8  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  31.35 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  31.35 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  26.64 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  40.52 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  31.25 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  27.73 
 
 
279 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 
304 aa  72.4  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 
300 aa  72  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4430  alpha/beta fold family hydrolase  24.39 
 
 
287 aa  72  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 
273 aa  71.6  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4481  hydrolase, alpha/beta fold family  24.9 
 
 
294 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 
290 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 
350 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
272 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  36.97 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4196  alpha/beta hydrolase fold  24.59 
 
 
294 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  31.58 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  29.18 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  35.94 
 
 
2762 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4246  alpha/beta fold family hydrolase  23.08 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000956714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4084  alpha/beta fold family hydrolase  23.08 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000349067  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4095  alpha/beta fold family hydrolase  23.08 
 
 
294 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787751  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4468  hydrolase, alpha/beta fold family  23.89 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4429  hydrolase, alpha/beta fold family  23.08 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4577  alpha/beta fold family hydrolase  23.08 
 
 
287 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  24.22 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  31.32 
 
 
387 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  37.82 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
277 aa  70.5  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 
277 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  28.81 
 
 
292 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  27.82 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
284 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  30.7 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  31.58 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  31.58 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5402  3-oxoadipate enol-lactonase  26.59 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  31.58 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  26.15 
 
 
286 aa  69.7  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  31.58 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  24.56 
 
 
302 aa  69.3  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  31.58 
 
 
300 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  39 
 
 
260 aa  68.9  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2886  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
290 aa  69.3  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2849  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
254 aa  68.9  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 
290 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 
279 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  36.61 
 
 
284 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3547  3-oxoadipate enol-lactonase  27.82 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  28.78 
 
 
291 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0769  hydrolase, alpha/beta fold family  23.79 
 
 
294 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000479635  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1941  alpha/beta hydrolase fold  39.36 
 
 
291 aa  68.9  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0494053  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  26.59 
 
 
396 aa  68.6  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>