More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3797 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3797  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 248 aa  489  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  45.09 
 
 		 250 aa  175  8e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  36.56 
 
 		 229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2073  alpha/beta hydrolase fold protein  33.63 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 		 275 aa  95.5  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  33.47 
 
 		 261 aa  87.8  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3478  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 		 295 aa  85.9  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  33.76 
 
 		 256 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  33.76 
 
 		 256 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  26.91 
 
 		 270 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  28.06 
 
 		 270 aa  85.5  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  32.5 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  33.76 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  28.44 
 
 		 267 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  26.29 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  31.58 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  29.64 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1692  alpha/beta hydrolase fold protein  28.51 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155751 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  28.44 
 
 		 281 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  26.98 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  31.08 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3365  alpha/beta hydrolase fold  33.87 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.6363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  27.39 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  27.39 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3293  alpha/beta hydrolase fold  32.68 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104393  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  30.77 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  27.57 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3436  alpha/beta hydrolase  26.95 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  27.8 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  32.14 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3606  alpha/beta hydrolase fold  37.31 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  30.96 
 
 		 425 aa  77.4  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  28.12 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  30.2 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  26.83 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  26.75 
 
 		 267 aa  75.5  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  26.41 
 
 		 272 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 275 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 		 280 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  25.4 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  24.6 
 
 		 264 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3368  alpha/beta hydrolase fold protein  32.16 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1106  alpha/beta hydrolase fold protein  31.85 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.112481  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  25.4 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  31.55 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  25.4 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  29.1 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  25.4 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  24.29 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  31.7 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  23.69 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  27.56 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3177  Alpha/beta hydrolase fold-1  30.88 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.97494  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.74 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  23.85 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4021  alpha/beta hydrolase fold protein  29.8 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.000000197083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0795  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.814605  normal  0.361628 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3907  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804884  normal  0.943348 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  32.52 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  27.56 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  30.81 
 
 		 270 aa  72  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  28.86 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  25.4 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  27.39 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  24.49 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  31.95 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  25.69 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1209  esterase/lipase  24.34 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  28.86 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  26.75 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  25.78 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  26.51 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  27.38 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1586  alpha/beta hydrolase fold  24.14 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  31.54 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  27.57 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  29.05 
 
 		 316 aa  69.3  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2519  alpha/beta hydrolase fold  30.09 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54258 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1287  alpha/beta hydrolase fold protein  28.94 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00130508  normal  0.0205637 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  26.8 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  29.46 
 
 		 285 aa  68.9  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 		 286 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>