More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3489 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 284 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1703  alpha/beta hydrolase fold  90.49 
 
 		 284 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3736  alpha/beta hydrolase fold  90.14 
 
 		 284 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4164  alpha/beta fold family hydrolase  90.14 
 
 		 284 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4202  epoxide hydrolase  75.27 
 
 		 284 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  73.67 
 
 		 284 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  71.17 
 
 		 284 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  66.55 
 
 		 287 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  64.44 
 
 		 300 aa  348  7e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3651  putative hydrolase  66.32 
 
 		 286 aa  344  8e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  65.96 
 
 		 286 aa  341  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2124  alpha/beta hydrolase fold  36.04 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321379 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2095  putative hydrolase  36.06 
 
 		 299 aa  171  9e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3992  alpha/beta hydrolase fold  40.84 
 
 		 284 aa  169  5e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  40.46 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  34.77 
 
 		 315 aa  162  7e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2967  alpha/beta hydrolase fold  40.07 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.594676 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  37.15 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  34.27 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  34.27 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  34.27 
 
 		 288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  36.55 
 
 		 291 aa  152  8e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2470  alpha/beta hydrolase  39.78 
 
 		 289 aa  151  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  34.04 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 		 288 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2109  alpha/beta hydrolase fold  35.86 
 
 		 294 aa  149  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139583  normal  0.535795 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  33.72 
 
 		 282 aa  146  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  33.22 
 
 		 288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  33.68 
 
 		 288 aa  145  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  33.33 
 
 		 282 aa  145  7.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01136  hydrolase, alpha/beta fold family protein  36.33 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3301  alpha/beta hydrolase fold  35.19 
 
 		 308 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2567  alpha/beta fold family hydrolase  34.81 
 
 		 308 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3148  alpha/beta hydrolase fold  38.24 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1624  alpha/beta hydrolase fold  35.07 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.142246  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1732  alpha/beta hydrolase fold  32.09 
 
 		 297 aa  137  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259687  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1935  alpha/beta fold family hydrolase  32.8 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1408  hypothetical protein  28.62 
 
 		 283 aa  129  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2189  alpha/beta hydrolase fold  33 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113055  hitchhiker  0.000974583 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03843  hydrolase  35.02 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45778  predicted protein  31.87 
 
 		 359 aa  120  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1187  putative lipase  32.18 
 
 		 308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  31.14 
 
 		 2762 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004091  predicted hydrolase/acyltransferase  32.41 
 
 		 284 aa  115  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1592  hypothetical protein  28.57 
 
 		 255 aa  113  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01378  hypothetical protein  30 
 
 		 284 aa  113  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0907  putative hydrolase  30.11 
 
 		 289 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1571  hypothetical protein  31.68 
 
 		 284 aa  102  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0811227  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  28.32 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  30.77 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0515  alpha/beta hydrolase fold  33.19 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  25.54 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  29.44 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  28.05 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  31.12 
 
 		 282 aa  79  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0079  alpha/beta hydrolase superfamily protein  31.42 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  33.12 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  31.96 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  37.61 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0043  alpha/beta hydrolase fold protein  36.13 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0261008  normal  0.0287829 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  26.29 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1960  alpha/beta hydrolase fold  42.42 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.877716  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  36.46 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  32.12 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0437  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.885291  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1071  alpha/beta hydrolase fold protein  35.2 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7902  alpha/beta hydrolase fold protein  36.5 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2728  alpha/beta hydrolase fold  38.1 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal  0.292016 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2742  alpha/beta hydrolase fold  40.35 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2698  alpha/beta hydrolase fold  40.35 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.705965  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 		 294 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  39.13 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4919  alpha/beta hydrolase fold protein  45.54 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582438  normal  0.155895 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  34.86 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00660  Alpha/beta hydrolase fold protein  39.81 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  38.39 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0650  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0635  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3868  alpha/beta hydrolase fold  40.18 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  34.6 
 
 		 3045 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2101  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3071  alpha/beta hydrolase fold  33.66 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.357729  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4177  alpha/beta hydrolase fold protein  40.18 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4196  alpha/beta hydrolase fold  33.66 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  39.25 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1245  alpha/beta hydrolase fold  39.39 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.433154 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  33.03 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3201  alpha/beta fold family hydrolase  30.25 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0736141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  33.03 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  33.03 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  33.85 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  36.27 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  33.03 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  26.87 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  33.03 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  33.03 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4481  hydrolase, alpha/beta fold family  32.67 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>