More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1571 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1571  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  584  1e-166  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0811227  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01378  hypothetical protein  58.01 
 
 		 284 aa  319  3e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004091  predicted hydrolase/acyltransferase  56.63 
 
 		 284 aa  307  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0907  putative hydrolase  43.53 
 
 		 289 aa  221  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  38.7 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  37.26 
 
 		 288 aa  152  7e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  37.93 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  38.31 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  36.92 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  37.6 
 
 		 288 aa  149  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  36.82 
 
 		 288 aa  145  5e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  36.82 
 
 		 288 aa  145  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1624  alpha/beta hydrolase fold  35.03 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.142246  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  36.4 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  34.13 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  34.13 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1935  alpha/beta fold family hydrolase  36.98 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1732  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259687  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01136  hydrolase, alpha/beta fold family protein  32.13 
 
 		 279 aa  136  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2109  alpha/beta hydrolase fold  36.64 
 
 		 294 aa  135  8e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139583  normal  0.535795 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  33.71 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2124  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321379 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  36.54 
 
 		 306 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3992  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  34 
 
 		 284 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  34.5 
 
 		 291 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1187  putative lipase  30.2 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  33.47 
 
 		 284 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45778  predicted protein  33.72 
 
 		 359 aa  119  4.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03843  hydrolase  34.62 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4202  epoxide hydrolase  31.09 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  32.66 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3651  putative hydrolase  32.86 
 
 		 286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  32.39 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3736  alpha/beta hydrolase fold  32.06 
 
 		 284 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2189  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 311 aa  109  6e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113055  hitchhiker  0.000974583 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4164  alpha/beta fold family hydrolase  32.06 
 
 		 284 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  32.94 
 
 		 300 aa  108  9.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1703  alpha/beta hydrolase fold  32.06 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2095  putative hydrolase  30.2 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  31.68 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  33.08 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1408  hypothetical protein  31.78 
 
 		 283 aa  105  7e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2470  alpha/beta hydrolase  33.95 
 
 		 289 aa  103  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1592  hypothetical protein  31.01 
 
 		 255 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  30.71 
 
 		 285 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 289 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2967  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 		 308 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.594676 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 289 aa  87.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  30.31 
 
 		 289 aa  85.9  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 		 327 aa  85.1  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  30.95 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1173  alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.95564  decreased coverage  0.000000135804 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3301  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 		 308 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  30.32 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2567  alpha/beta fold family hydrolase  28.74 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  30.32 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3148  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2138  alpha/beta hydrolase fold  38.21 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2011  alpha/beta hydrolase fold  37.4 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219515 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1098  Alpha/beta hydrolase fold  37.23 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5407  Alpha/beta hydrolase  37.4 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.632759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2119  alpha/beta hydrolase fold  37.4 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2772  putative hydrolase protein  41.96 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5976  alpha/beta hydrolase fold  37.4 
 
 		 296 aa  72  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2101  alpha/beta hydrolase fold  37.4 
 
 		 296 aa  72  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1900  alpha/beta fold family hydrolase  35.42 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2186  alpha/beta fold family hydrolase  28.78 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1684  alpha/beta fold family hydrolase  34.72 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.163104  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1459  alpha/beta fold family hydrolase  34.72 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2571  alpha/beta fold family hydrolase  34.72 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3131  alpha/beta fold family hydrolase  34.72 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2704  alpha/beta fold family hydrolase  34.72 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2625  alpha/beta fold family hydrolase  34.72 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738195  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3081  alpha/beta hydrolase fold protein  34.92 
 
 		 371 aa  68.9  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0542902  normal  0.696639 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  26.4 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1074  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1135  putative hydrolase protein  30.27 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4804  alpha/beta hydrolase fold  33.12 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  26.24 
 
 		 2762 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0437  alpha/beta hydrolase fold protein  29.45 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.885291  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2699  alpha/beta hydrolase  37.17 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  34.59 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  28.05 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2554  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000366635  normal  0.152292 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03993  putative bioH protein  35.19 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.39714  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04395  hydrolase, alpha/beta fold family protein  22.96 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.681804  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1062  alpha/beta hydrolase fold  37.61 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00192187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3251  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0874027  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  35.45 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  39.42 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4523  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  37.37 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5466  alpha/beta hydrolase fold  25.42 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0306241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5377  alpha/beta hydrolase fold  25.42 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>