More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01136 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01136  hydrolase, alpha/beta fold family protein  100 
 
 		 279 aa  578  1e-164  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  37.28 
 
 		 315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  36.79 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  36.79 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  36.79 
 
 		 288 aa  180  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  36.79 
 
 		 288 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  36.07 
 
 		 288 aa  176  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 		 288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 		 288 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  36.07 
 
 		 288 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  36.07 
 
 		 288 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3992  alpha/beta hydrolase fold  34.67 
 
 		 284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  39.55 
 
 		 284 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  37.83 
 
 		 284 aa  161  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1187  putative lipase  34.78 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  35.09 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0907  putative hydrolase  33.09 
 
 		 289 aa  155  8e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1935  alpha/beta fold family hydrolase  34.89 
 
 		 311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004091  predicted hydrolase/acyltransferase  32.99 
 
 		 284 aa  152  7e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2109  alpha/beta hydrolase fold  33.8 
 
 		 294 aa  150  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139583  normal  0.535795 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  34.84 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01378  hypothetical protein  31.49 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  33.96 
 
 		 287 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  34.94 
 
 		 300 aa  145  8.000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  36.33 
 
 		 284 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1703  alpha/beta hydrolase fold  35.82 
 
 		 284 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4164  alpha/beta fold family hydrolase  35.82 
 
 		 284 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4202  epoxide hydrolase  35.21 
 
 		 284 aa  142  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  35.92 
 
 		 306 aa  142  6e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1624  alpha/beta hydrolase fold  35.79 
 
 		 306 aa  142  8e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.142246  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3736  alpha/beta hydrolase fold  35.96 
 
 		 284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3651  putative hydrolase  36.55 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  36.13 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2124  alpha/beta hydrolase fold  34.56 
 
 		 294 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321379 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2189  alpha/beta hydrolase fold  31.86 
 
 		 311 aa  135  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113055  hitchhiker  0.000974583 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1732  alpha/beta hydrolase fold  31.36 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259687  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03843  hydrolase  32.63 
 
 		 244 aa  132  9e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1571  hypothetical protein  32.13 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0811227  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  31.68 
 
 		 282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  31.68 
 
 		 282 aa  126  5e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1408  hypothetical protein  30.15 
 
 		 283 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2470  alpha/beta hydrolase  31.69 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1592  hypothetical protein  29.69 
 
 		 255 aa  119  7.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2967  alpha/beta hydrolase fold  32.61 
 
 		 308 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.594676 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2095  putative hydrolase  29.21 
 
 		 299 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3301  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2567  alpha/beta fold family hydrolase  32.47 
 
 		 308 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3148  alpha/beta hydrolase fold  32.47 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 327 aa  88.2  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45778  predicted protein  24.38 
 
 		 359 aa  87.4  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  26.64 
 
 		 2762 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  27.55 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  28.9 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  26.3 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  28.76 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  23.57 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  26.25 
 
 		 359 aa  75.1  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  28.09 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  26.06 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3251  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0874027  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1899  alpha/beta hydrolase fold protein  36.67 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  25.76 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 		 270 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  28.36 
 
 		 3045 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 		 291 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 		 305 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 		 291 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 		 291 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1900  alpha/beta fold family hydrolase  29.1 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  24.55 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  31.19 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  31.19 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  32.2 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  31.19 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3131  alpha/beta fold family hydrolase  28.73 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1459  alpha/beta fold family hydrolase  28.73 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2625  alpha/beta fold family hydrolase  28.73 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738195  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1684  alpha/beta fold family hydrolase  28.73 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.163104  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1098  Alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2704  alpha/beta fold family hydrolase  28.73 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2186  alpha/beta fold family hydrolase  28.73 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  21.13 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  32.71 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  33.81 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  37.29 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  24.73 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2571  alpha/beta fold family hydrolase  28.36 
 
 		 349 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6816  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 		 282 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 		 308 aa  62.4  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8768  putative hydrolase  34.15 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3526  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  33.65 
 
 		 282 aa  62.4  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>