More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2027 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 284 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  84.15 
 
 		 284 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4202  epoxide hydrolase  73.05 
 
 		 284 aa  418  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3736  alpha/beta hydrolase fold  72.95 
 
 		 284 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4164  alpha/beta fold family hydrolase  71.89 
 
 		 284 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1703  alpha/beta hydrolase fold  71.89 
 
 		 284 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  71.17 
 
 		 284 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  66.9 
 
 		 287 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  64.46 
 
 		 300 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3651  putative hydrolase  66.32 
 
 		 286 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  65.61 
 
 		 286 aa  363  2e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3992  alpha/beta hydrolase fold  44.83 
 
 		 284 aa  193  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2095  putative hydrolase  35.02 
 
 		 299 aa  183  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  42.48 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  37 
 
 		 315 aa  179  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2124  alpha/beta hydrolase fold  36.04 
 
 		 294 aa  179  5.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321379 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  37.32 
 
 		 288 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  37.32 
 
 		 288 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  35.38 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  33.82 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  36.97 
 
 		 288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2470  alpha/beta hydrolase  39.78 
 
 		 289 aa  162  9e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01136  hydrolase, alpha/beta fold family protein  37.83 
 
 		 279 aa  161  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2109  alpha/beta hydrolase fold  35.48 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139583  normal  0.535795 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  36.62 
 
 		 288 aa  159  5e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  36.82 
 
 		 291 aa  159  6e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  34.98 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  34.98 
 
 		 288 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  34.86 
 
 		 288 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  34.86 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2967  alpha/beta hydrolase fold  35.16 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.594676 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1732  alpha/beta hydrolase fold  32.44 
 
 		 297 aa  148  8e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259687  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1624  alpha/beta hydrolase fold  34.47 
 
 		 306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.142246  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03843  hydrolase  38.82 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3301  alpha/beta hydrolase fold  35.38 
 
 		 308 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  34.74 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2567  alpha/beta fold family hydrolase  36.9 
 
 		 308 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3148  alpha/beta hydrolase fold  36.9 
 
 		 308 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1187  putative lipase  30.74 
 
 		 308 aa  138  7.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1935  alpha/beta fold family hydrolase  32.69 
 
 		 311 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01378  hypothetical protein  31.6 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004091  predicted hydrolase/acyltransferase  33.06 
 
 		 284 aa  133  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1408  hypothetical protein  29.37 
 
 		 283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45778  predicted protein  32.08 
 
 		 359 aa  124  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2189  alpha/beta hydrolase fold  36.15 
 
 		 311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113055  hitchhiker  0.000974583 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0907  putative hydrolase  29.15 
 
 		 289 aa  119  3.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1571  hypothetical protein  33.47 
 
 		 284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0811227  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1592  hypothetical protein  29.34 
 
 		 255 aa  112  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  28.73 
 
 		 2762 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 		 300 aa  92.4  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  31.56 
 
 		 285 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 		 327 aa  88.6  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  31.15 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0079  alpha/beta hydrolase superfamily protein  28.89 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0043  alpha/beta hydrolase fold protein  29.01 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0261008  normal  0.0287829 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0515  alpha/beta hydrolase fold  41.13 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1960  alpha/beta hydrolase fold  43.88 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.877716  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4804  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0437  alpha/beta hydrolase fold protein  29.46 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.885291  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  37.14 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  35.2 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4953  alpha/beta hydrolase fold  35.61 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4764  alpha/beta hydrolase fold  40.54 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  35.53 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  27.15 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  30.91 
 
 		 288 aa  67  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  36.36 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  35 
 
 		 260 aa  67  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  36.79 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  31.2 
 
 		 3045 aa  66.2  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  35.11 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  26.15 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3868  alpha/beta hydrolase fold  41.67 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  36.54 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5124  alpha/beta hydrolase fold protein  33.97 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4919  alpha/beta hydrolase fold protein  40.16 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582438  normal  0.155895 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4177  alpha/beta hydrolase fold protein  41.67 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  36.55 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  35.48 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  35.94 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  40.18 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1899  alpha/beta hydrolase fold protein  32.47 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4324  alpha/beta hydrolase fold  39.29 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2728  alpha/beta hydrolase fold  40.35 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal  0.292016 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  36.89 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2305  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  28.37 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  34.55 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2742  alpha/beta hydrolase fold  40.35 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6061  alpha/beta hydrolase fold  39.81 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507305  normal  0.301702 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2698  alpha/beta hydrolase fold  40.35 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.705965  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  34.19 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>