More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2218 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  100 
 
 		 284 aa  568  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  84.15 
 
 		 284 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4202  epoxide hydrolase  74.47 
 
 		 284 aa  422  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3736  alpha/beta hydrolase fold  73.67 
 
 		 284 aa  411  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  73.67 
 
 		 284 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4164  alpha/beta fold family hydrolase  72.95 
 
 		 284 aa  407  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1703  alpha/beta hydrolase fold  72.95 
 
 		 284 aa  407  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  68.66 
 
 		 287 aa  395  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  66.2 
 
 		 300 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3651  putative hydrolase  66.32 
 
 		 286 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  65.96 
 
 		 286 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3992  alpha/beta hydrolase fold  45.21 
 
 		 284 aa  198  7.999999999999999e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2124  alpha/beta hydrolase fold  37.81 
 
 		 294 aa  185  7e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321379 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  39.34 
 
 		 315 aa  182  7e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2095  putative hydrolase  36.27 
 
 		 299 aa  180  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  42.37 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  36.6 
 
 		 282 aa  170  3e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  36.23 
 
 		 282 aa  168  8e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01136  hydrolase, alpha/beta fold family protein  39.55 
 
 		 279 aa  163  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2470  alpha/beta hydrolase  39.78 
 
 		 289 aa  162  7e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  35.92 
 
 		 288 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  37.37 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2967  alpha/beta hydrolase fold  38.33 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.594676 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03843  hydrolase  40.59 
 
 		 244 aa  153  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1732  alpha/beta hydrolase fold  32.89 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259687  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  35.21 
 
 		 288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  35.56 
 
 		 288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  35.56 
 
 		 288 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  35.21 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  35.21 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3301  alpha/beta hydrolase fold  38.15 
 
 		 308 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1624  alpha/beta hydrolase fold  35.49 
 
 		 306 aa  149  6e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.142246  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  34.93 
 
 		 298 aa  148  9e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2109  alpha/beta hydrolase fold  35.49 
 
 		 294 aa  145  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139583  normal  0.535795 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2567  alpha/beta fold family hydrolase  37.78 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3148  alpha/beta hydrolase fold  37.78 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  34.49 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1935  alpha/beta fold family hydrolase  34.08 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1408  hypothetical protein  29.02 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1187  putative lipase  31.13 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45778  predicted protein  34.42 
 
 		 359 aa  128  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004091  predicted hydrolase/acyltransferase  33.2 
 
 		 284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0907  putative hydrolase  30.04 
 
 		 289 aa  125  6e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01378  hypothetical protein  30.31 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2189  alpha/beta hydrolase fold  36.61 
 
 		 311 aa  123  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113055  hitchhiker  0.000974583 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  30.31 
 
 		 2762 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1571  hypothetical protein  34 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0811227  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1592  hypothetical protein  29.34 
 
 		 255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 300 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  31.3 
 
 		 285 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 		 327 aa  82.4  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0515  alpha/beta hydrolase fold  32.69 
 
 		 290 aa  82  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0079  alpha/beta hydrolase superfamily protein  27.34 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  28.7 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0043  alpha/beta hydrolase fold protein  29.53 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0261008  normal  0.0287829 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  36.64 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1960  alpha/beta hydrolase fold  43.88 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.877716  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  38.1 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0437  alpha/beta hydrolase fold protein  27.73 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.885291  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  41.44 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  38.4 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4919  alpha/beta hydrolase fold protein  42.62 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582438  normal  0.155895 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  25.52 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1173  proline iminopeptidase, putative  30.13 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  26.7 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  33.54 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  39.39 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  39.55 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  39.42 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  39.39 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  36.61 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  36.61 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4764  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  38.1 
 
 		 351 aa  67  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  28.03 
 
 		 290 aa  67  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  37.7 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1899  alpha/beta hydrolase fold protein  30.41 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2305  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  41.96 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  33.56 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4953  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 		 360 aa  65.9  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  33.6 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  34.69 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3868  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  36.79 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0074  alpha/beta hydrolase fold protein  29.94 
 
 		 255 aa  65.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204649 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  30.94 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4177  alpha/beta hydrolase fold protein  42.86 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  32.4 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  32.72 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  32.89 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  38.05 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6061  alpha/beta hydrolase fold  40.74 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507305  normal  0.301702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>