More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1960 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1960  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 278 aa  547  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.877716  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4764  alpha/beta hydrolase fold  77.97 
 
 		 300 aa  448  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  37.97 
 
 		 291 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  36.09 
 
 		 300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  34.52 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 		 291 aa  116  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  31.52 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  31.93 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  32.16 
 
 		 288 aa  106  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  31.67 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  31.18 
 
 		 293 aa  99  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  32.3 
 
 		 349 aa  97.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 		 289 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1047  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 275 aa  95.9  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.975256  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 286 aa  95.5  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  29.08 
 
 		 301 aa  95.1  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  29.39 
 
 		 334 aa  94  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  25.98 
 
 		 290 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 291 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 291 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  30.21 
 
 		 308 aa  92.4  8e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 		 284 aa  92  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  30.07 
 
 		 307 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  32.62 
 
 		 270 aa  91.3  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 291 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  32.48 
 
 		 289 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 287 aa  90.1  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  28.2 
 
 		 304 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  28.03 
 
 		 304 aa  89  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  28.03 
 
 		 304 aa  89  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 		 287 aa  88.6  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  30.47 
 
 		 311 aa  88.2  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0491  alpha/beta hydrolase fold  31.32 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  23.93 
 
 		 287 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  31.14 
 
 		 288 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2518  alpha/beta hydrolase fold protein  27.55 
 
 		 337 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 		 287 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  25.56 
 
 		 283 aa  85.5  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  27.56 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  38.46 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  31.23 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3036  alpha/beta hydrolase fold protein  32.72 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  33.84 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  27.05 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6173  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2052  alpha/beta hydrolase fold  27.49 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  26.74 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7153  alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2917  alpha/beta hydrolase  25.98 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  27.91 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 288 aa  83.2  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  36.07 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  42.02 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 		 290 aa  82  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2473  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 		 324 aa  82  0.000000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0409911  normal  0.0604811 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  25.77 
 
 		 314 aa  82  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1381  alpha/beta hydrolase fold protein  32 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0503  alpha/beta hydrolase fold protein  32.27 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988269  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6270  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 		 340 aa  81.3  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.882285  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1476  alpha/beta hydrolase fold  27.85 
 
 		 345 aa  81.6  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479642  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  28.99 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  25.45 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6177  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 		 343 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0813  alpha/beta hydrolase fold protein  29.56 
 
 		 350 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875256  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2769  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3910  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 		 348 aa  80.5  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.990373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2775  alpha/beta hydrolase  29.43 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  25.72 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  24.82 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1448  alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.358742 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2009  alpha/beta hydrolase fold  25.52 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  36.22 
 
 		 323 aa  79.3  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  25.63 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3835  Alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0435059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 		 328 aa  79.3  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2254  epoxide hydrolase  28.82 
 
 		 347 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2767  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  29.59 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  24.6 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4275  putative hydrolase  27.65 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0484838 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  25.43 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  27.15 
 
 		 349 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.491211  normal  0.309577 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1728  alpha/beta hydrolase fold protein  33.1 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.0268844 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  28.15 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0650  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477317  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6469  haloalkane dehalogenase  35.71 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1453  alpha/beta hydrolase fold  32.39 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  23.7 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  39.84 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>