More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3502 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3502  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 268 aa  530  1e-149  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0503333  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4667  alpha/beta hydrolase fold  49.62 
 
 		 260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113193  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1800  alpha/beta hydrolase fold  46.42 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155348 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1130  alpha/beta hydrolase fold protein  43.4 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.755121  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13227  lipase lipV  44.15 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1402  alpha/beta hydrolase fold  43.98 
 
 		 279 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1420  alpha/beta hydrolase fold  43.98 
 
 		 279 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1456  alpha/beta hydrolase fold  43.61 
 
 		 260 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.648204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2024  alpha/beta hydrolase fold  39.42 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3527  alpha/beta hydrolase fold protein  28.23 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  32.24 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1970  alpha/beta hydrolase fold  36.89 
 
 		 311 aa  67  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000319634  normal  0.0578642 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  29.58 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  37.61 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  38.94 
 
 		 431 aa  65.5  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1025  alpha/beta hydrolase fold protein  39.6 
 
 		 301 aa  65.5  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  38.38 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2404  alpha/beta hydrolase fold  39.09 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367269 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  39.42 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  39.18 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3821  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  30.39 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  39.42 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  33.94 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  39.17 
 
 		 340 aa  62.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1498  alpha/beta hydrolase fold  38.83 
 
 		 324 aa  62.4  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4250  alpha/beta hydrolase fold protein  35.54 
 
 		 352 aa  62  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.2493  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3436  alpha/beta hydrolase  34.43 
 
 		 256 aa  62  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2124  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321379 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0255  alpha/beta hydrolase fold protein  33.95 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  33.88 
 
 		 340 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  29.71 
 
 		 2762 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  29.47 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  34.71 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  34.71 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1744  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  34.71 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  32.41 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.754545  normal  0.278795 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  36.79 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3531  alpha/beta hydrolase fold protein  32.64 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.290128  normal  0.539158 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0221  putative hydrolase  28.57 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.555704  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2860  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390288 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2109  alpha/beta hydrolase fold  28.92 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139583  normal  0.535795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7902  alpha/beta hydrolase fold protein  38.53 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  38.24 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  33.98 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.6 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004031  2-succinyl-6-hydroxy-2, 4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase  25.7 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  39.09 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  34.23 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  32.43 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1586  alpha/beta hydrolase fold  36.07 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1121  alpha/beta hydrolase fold protein  33.61 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  29.23 
 
 		 335 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 		 295 aa  57  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3298  hypothetical protein  28.36 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  37.61 
 
 		 304 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  36.61 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  36.44 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2165  alpha/beta hydrolase fold protein  32.04 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1941  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0494053  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  29.26 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  37.17 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1579  alpha/beta hydrolase fold  37.21 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  33.03 
 
 		 504 aa  56.2  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0871  alpha/beta hydrolase fold protein  33.62 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2939  Alpha/beta hydrolase  29.17 
 
 		 345 aa  55.8  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1555  alpha/beta hydrolase fold  37.21 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2863  alpha/beta hydrolase fold protein  38.1 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.334442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1525  alpha/beta hydrolase fold  37.21 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0190867  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  33.61 
 
 		 456 aa  55.8  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1935  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  35.4 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  36.21 
 
 		 341 aa  55.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1030  alpha/beta hydrolase fold  34.83 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2154  alpha/beta hydrolase fold protein  42.16 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016859 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4035  alpha/beta hydrolase fold protein  29.56 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.688921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3993  alpha/beta hydrolase fold protein  29.56 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4415  Alpha/beta hydrolase fold  37.62 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  36.84 
 
 		 303 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  33.03 
 
 		 308 aa  55.5  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1683  hydrolase  24.9 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000746451  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  26.95 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  36.84 
 
 		 303 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>