More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0255 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0255  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
258 aa  513  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3527  alpha/beta hydrolase fold protein  48.37 
 
 
294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
275 aa  79.3  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
289 aa  74.7  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  30.15 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0587  alpha/beta hydrolase fold protein  31.08 
 
 
258 aa  73.6  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2954  hydrolase  27.32 
 
 
294 aa  72  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000251178  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3478  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2890  hydrolase  31.45 
 
 
294 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  24.32 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 
282 aa  69.7  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  37.7 
 
 
431 aa  69.7  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  43 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3502  alpha/beta hydrolase fold protein  35.68 
 
 
268 aa  68.6  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0503333  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2963  alpha/beta fold family hydrolase  31.71 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0480024  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3187  alpha/beta fold family hydrolase  31.71 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  41 
 
 
340 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  42.16 
 
 
278 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3194  hydrolase, alpha/beta fold family  31.71 
 
 
294 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4667  alpha/beta hydrolase fold  38.33 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113193  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  23.55 
 
 
327 aa  65.5  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1130  alpha/beta hydrolase fold protein  31.46 
 
 
254 aa  64.7  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.755121  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 
289 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  23.62 
 
 
270 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4574  alpha/beta fold family hydrolase  34.38 
 
 
266 aa  64.3  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  36.75 
 
 
341 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  23.62 
 
 
270 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3436  alpha/beta hydrolase  27.61 
 
 
256 aa  63.9  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1209  esterase/lipase  30.83 
 
 
311 aa  63.9  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0961  alpha/beta hydrolase fold protein  28.86 
 
 
284 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822428  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3201  alpha/beta fold family hydrolase  30.65 
 
 
294 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0736141  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  38.52 
 
 
302 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5586  alpha/beta hydrolase fold  33.71 
 
 
326 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  39.8 
 
 
340 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  37.72 
 
 
2762 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  24.02 
 
 
270 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  39.8 
 
 
340 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  39.8 
 
 
340 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  37.29 
 
 
286 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2165  alpha/beta hydrolase fold protein  32.73 
 
 
255 aa  62.8  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  23.35 
 
 
270 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1923  alpha/beta hydrolase fold protein  25.27 
 
 
304 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 
294 aa  62  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0608  alpha/beta hydrolase fold  31.53 
 
 
311 aa  62  0.000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000717376  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  23.35 
 
 
270 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3841  alpha/beta hydrolase fold  34.78 
 
 
267 aa  62  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.819174  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  35.77 
 
 
280 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  27.76 
 
 
269 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  22.83 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  35.77 
 
 
303 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  35.77 
 
 
303 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  35.77 
 
 
280 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35370  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2544  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 
285 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  22.83 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  36.61 
 
 
504 aa  61.6  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  35.77 
 
 
303 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  35.77 
 
 
303 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3768  alpha/beta hydrolase fold  34.78 
 
 
267 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  35.77 
 
 
303 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  23.46 
 
 
270 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  35.82 
 
 
300 aa  61.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4878  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 
281 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345435  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  31.39 
 
 
308 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.98 
 
 
276 aa  60.1  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  34.96 
 
 
581 aa  60.1  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  38 
 
 
269 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 
290 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01343  hypothetical protein  35.04 
 
 
255 aa  59.7  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  24.02 
 
 
270 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1667  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 
305 aa  59.7  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3251  alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 
292 aa  59.7  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0874027  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  28.19 
 
 
303 aa  59.3  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
314 aa  59.7  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4433  alpha/beta hydrolase fold  36.45 
 
 
275 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  41 
 
 
298 aa  59.3  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4206  alpha/beta hydrolase fold  36.45 
 
 
275 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.381827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4272  alpha/beta hydrolase fold  36.45 
 
 
275 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.328456  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0208  alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 
259 aa  58.9  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.931775  hitchhiker  0.0000130442 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  22.9 
 
 
262 aa  58.9  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 
275 aa  58.9  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13227  lipase lipV  35.29 
 
 
261 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 
295 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3669  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 
306 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  35.96 
 
 
280 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  36.75 
 
 
456 aa  58.9  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  31.08 
 
 
291 aa  58.9  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1647  alpha/beta hydrolase fold protein  35.45 
 
 
276 aa  58.5  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  26.46 
 
 
277 aa  58.5  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  38.18 
 
 
322 aa  58.9  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  38.14 
 
 
291 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4158  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 
264 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 
258 aa  58.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2746  hydrolase, alpha/beta fold family  26.52 
 
 
287 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000102872 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
264 aa  58.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1435  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 
253 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.458489  normal  0.862062 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  36 
 
 
350 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1800  alpha/beta hydrolase fold  38.94 
 
 
260 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.155348 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2343  alpha/beta hydrolase fold  43.93 
 
 
279 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.302019  decreased coverage  0.000831021 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>